S.cerevisiae - Yeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

YNCQ0026W

Promoter Sequence

Consensus
WTAWTW: -998 -992 -989 -984 -980 -974 -954 -951 -946 -937 -934 -931 -926 -910 -906 -902 -899 -896 -893 -890 -880 -877 -758 -748 -744 -741 -738 -731 -665 -656 -642 -635 -615 -609 -605 -601 -597 -593 -589 -574 -568 -564 -561 -558 -555 -552 -495 -472 -469 -466 -457 -450 -431 -426 -419 -415 -388 -363 -347 -335 -332 -329 -326 -314 -232 -214 -207 -196 -185 -163 -147 -142 -139 -132 -108 -91 -87 -84 -78 -62 -45 -24 -12

>YNCQ0026W    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
ATATATTTATAATAan>ATA>TATTTn>AATTATAATTTATAAAAAAGAGATATAATAan>TTT>TATTA
TATATAATAan>TTAan>ATA>TAATACAAATTAACATTATTTn>AATTn>ATTAan>TTAan>ATAan>ATAan>TTTAACT
TTATTAan>TTATCTTCTACGGTTGGACTCCTTCTTAAAAAGGGGTTCGGTCCCCCTCCCATT
AGGGAGGGGTCCCTCACTCCTTCGGGGTCCGCGCCCCCCGCGGGGGGGGGCGGACCGGAC
TATTATTACTATTTATTTn>ATTAan>ATAan>ATAAATAATAAATTATAAAGTCACTGAAAGAGTGA
GGAATTTTCCTTTTCCCAAGGGAAAACCCCAAAGGATAATATAAATATTATAAAATTTTT
ATTAAATAATATAAAATTCAATAAAATAATTTTAATTn>AATTn>AATTn>AATTn>AATTn>AATATAA
AAATAAATATTTTTAATTn>AATAan>TTAan>ATAan>TTAan>ATAGTTCCGGGGCCCGGCCACGGGAGCCG
GAACCCCGGAAGGAGAAATATAAATATAATAGTATAGTATATAGGAAGTTAATAan>ATAan>ATA
TAAATATTATATAATATATATATGTATATATATTA>TATTATATAATTn>AATTTTCTCCTTT
TGTATTTACATCTTAATAAAATATAAAATATAAAATGTTATTAACAATAAAAATTATTAA
TCTTTATAATAan>TTAan>ATAan>ATAGTAAATTTATTTATATATCTCCTTTAGGATGGACTCCTTC
GGCCGGACTCCTTCGGGGTCCGCCCCGCGGGGGCGGGCCGGACTATTTTTATTTTTTTTT
TAAAAAATATTAAATATTATAAATATATTATAAATATATTATAAATATGTTATAAATATA
TTATAAATAGAATATAATA>TAATAan>TTATATATTATAATGATAAAGATTATATATATTTTC
TTTTTTTTTTTATTTn>ATTAan>TTTTTAATAAGTAAAAATTATATTATATATATATATATATT
AGATTTTATAAGTAATATAATATAAGTATTAATATATAAA

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
WTAWTW: -5 -8 -17 -22 -55 -60 -71 -80 -125 -132 -135 -140 -156 -161 -172 -178 -183 -189 -194 -200 -203 -207 -210 -322 -325 -328 -340 -343 -356 -369 -376 -381 -411 -419 -424 -443 -450 -453 -459 -462 -465 -493 -499 -548 -551 -554 -557 -560 -570 -574 -582 -585 -589 -593 -597 -601 -611 -628 -631 -635 -649 -652 -658 -719 -724 -727 -731 -734 -737 -754 -870 -873 -886 -889 -892 -895 -898 -912 -924 -927 -930 -939 -947 -972 -982 -985

>YNCQ0026W	Upstream Sequence Complementary Strand
TATATAAATATTATTan>ATATAAATTAATATTAAATATTTTTTCTCTATATTATAAAATAAT
ATATATTATAan>ATTan>ATATTATGTTTAATTGTAATAAATTAATAan>ATAan>ATTan>ATTan>ATAAATTGA
AATAATAan>ATAGAAGATGCCAACCTGAGGAAGAATTTTTCCCCAAGCCAGGGGGAGGGTAA
TCCCTCCCCAGGGAGTGAGGAAGCCCCAGGCGCGGGGGGCGCCCCCCCCCGCCTGGCCTG
ATAATAATGATAAATAAATAATTan>ATTan>ATTn>TATTan>ATT>TAATATTTCAGTGACTTTCTCACT
CCTTAAAAGGAAAAGGGTTCCCTTTTGGGGTTTCCTATTATATTTATAan>ATATTTTAAAAA
TAATTn>TATTan>ATATTTTAAGTTATTTTATTAAAATTAATTn>AATTn>AATTn>AATTn>AATTan>ATATT
TTTATTn>TATAAAAATTAATTan>ATAan>ATTan>ATAan>ATTATCAAGGCCCCGGGCCGGTGCCCTCGGC
CTTGGGGCCTTCCTCTTTATATTTATATTATCATATCATATATCCTTCAATTATTan>ATTan>AT
ATTTATAan>ATATATTATATATATACATATATATAATA>TAATATATTAATTAAAAGAGGAAA
ACATAAATGTAGAATTATT>TTATATTTTATATTTTACAATAATTGTTATTTTTAATAan>ATT
AGAAATATTATAan>ATTan>ATTATCATTTAAATAAATATATAGAGGAAATCCTACCTGAGGAAG
CCGGCCTGAGGAAGCCCCAGGCGGGGCGCCCCCGCCCGGCCTGATAAAAATAAAAAAAAA
ATTTTTTATAan>ATTn>TATAan>ATATTTATA>TAATATTTATA>TAATATTTATACAATATTTATA>T
AATATTTATCTTATATTATA>TTATAan>ATATATAATATTACTATTTCTAATATATATAAAAG
AAAAAAAAAAATAAATAATAAAAATTATTCATTTTTAATA>TAATATATATATATATATAA
TCTAAAATATTCATTATA>TTATATTCATAATTan>ATATATTT