Yeastract
Please fill in here our
user satisfaction survey
Thank you!
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Search by DNA motif > Result > View in Promoter Contact/Credits     Tutorial     Help

 

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name YNCQ0022W
Promoter Sequence

Consensus
WTAWTW: -998 -993 -981 -971 -967 -964 -938 -934 -931 -928 -923 -918 -911 -904 -899 -870 -853 -827 -818 -815 -807 -795 -786 -768 -765 -762 -758 -755 -752 -747 -742 -735 -731 -725 -716 -713 -708 -696 -693 -689 -667 -660 -655 -650 -647 -642 -637 -634 -592 -588 -585 -579 -576 -561 -530 -526 -517 -513 -507 -502 -497 -475 -469 -459 -449 -446 -429 -420 -415 -408 -405 -394 -391 -370 -362 -359 -353 -349 -345 -341 -337 -324 -321 -318 -312 -308 -304 -301 -272 -269 -263 -255 -242 -239 -236 -224 -217 -208 -197 -189 -185 -180 -173 -163 -160 -157 -152 -148 -143 -138 -127 -115 -111 -108 -105 -100 -97 -93 -83 -77 -49 -27 -21 -18 -15 -9
>YNCQ0022W    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TTATATTA>TATTTATTGATATATTTATTGATATTTn>ATTAan>ATTTAAGATTATTCATTAAAT
ATATAATTn>ATTAan>ATAan>ATT>TAATA>TATTTTATAATTTTTATTA>TATTTTATGTAAGAAGAA
ACTATTTTATATATTATATATATATATATAATTTTTATAAAATGATAAATTTTATATTAT
AAATATTAan>TTAAAATATTTTTATAAATATTTAAATTATTTATAAAAAGGTATATAATAan>AT
AATTn>ATTAan>ATAan>TTA>TATTA>TATTA
TATATTTn>ATTTATATTATATATAATAan>ATA>TATTTAT
ATATATATTAan>ATTn>AATAAATTAAATAAGTATCTATATTTTATATTA>TATTA>TATTAan>TTT>T
ATTT>TATTAan>ATT
CCGGAAGGAGAATAAAAAGTATTCTAAAGAAATTATATATTTn>ATTAan>TT
T
TTATTAan>ATATGTTATAAATTAATAAAAAATAAATATGTATATATAAATTATATTTn>ATTA
TGTTTAATTn>ATTTATAATT>TATTA>TAATATATAGTATAAGATATCTTATTTATATTTATA
TATAATAAAGAATATTAan>TTAAACTAACACCTATATTATATATATTA>TATTATATAATAan>TT
A
TATATATATTAan>ATTACTAAGAATAAATTTATAATTAGATAATAan>TTTATATTTn>ATTTn>ATT
TATTTn>AATT
AACAAATATATTAan>ATAan>TTTTTAATTn>AATTn>AATAan>ATACCTTTATATATATAT
ATATATATATATTAan>ATTTTAATTATATAATTATCTTTTTTATTAan>ATAan>ATTATAAATATAT
TA
TATATTTTATATAATAAGATTATAATTTTATAATTn>ATTT>TATTTTTTATTAAAAATTA
TTAan>TTAan>TTA>TAATTn>ATTA>TATTA>TAATT
ATAAATTATTAAAGAATATATTTn>ATTAan>ATAan>TT
T>TAATAan>ATTn>AATA
TCTTTTATTTATATTTATAAAATAAGGTATAAATATTGATAATAAAG
AGTAAATATTGTATTAATTATAATAan>ATAan>ATTATAATTAAG
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
WTAWTW: -1 -7 -11 -14 -19 -23 -31 -42 -51 -62 -86 -89 -93 -101 -104 -120 -123 -130 -136 -141 -144 -150 -153 -156 -159 -166 -181 -201 -217 -222 -228 -232 -235 -247 -255 -265 -297 -300 -304 -314 -317 -322 -329 -355 -387 -398 -401 -408 -413 -422 -439 -442 -452 -490 -495 -509 -519 -528 -543 -547 -554 -557 -569 -572 -581 -592 -630 -643 -648 -653 -673 -677 -682 -685 -689 -706 -709 -718 -735 -740 -745 -748 -751 -754 -758 -761 -782 -791 -803 -808 -811 -814 -820 -863 -897 -916 -924 -927 -930 -938 -960 -991
>YNCQ0022W	Upstream Sequence Complementary Strand
AATATAATATAAATAACTATATAAATAACTATAAATAATTAAATTCTAATAAGTAATTTA
TA
TATTAATAan>ATTan>ATTAAATTATATAAAATATTAAAAATAATATAAAATACATTCTTCTT
TGATAAAATATATAATATATATATATATATTAAAAATATTTTACTATTTAAAATATAATA
TTTATAan>ATAan>ATT>TTATAAAAATATTTATAAATTTAATAAATATTTTTCCATATATTATTan>A
TTn>AATAan>ATTan>ATAan>ATA>TAATA>TAATA
TATAAATAAATATAATATATATTATTan>ATATAAATA
TATATATAATTn>AATTan>ATT>TAATTn>TATTCATAGATATAAAATATAATA>TAATA>TAATAAAA
TAAAATAATTAAGGCCTTCCTCTTATTTTTCATAAGATTTCTTTAATATATAAATAATAA
AAATAATTan>ATACAATATTTAATTan>ATTTTTTATTn>TATACATATATATTTAATATAAATAAT
A
CAAATTAATAAATATTAAATAATA>TTATATATCATATTCTATAGAATAAATATAAATAT
ATATTATTTCTTATAATAan>ATTTGATTGTGGATATAATATATATAATA>TAATATATTATAan>A
TA
TATATATAATTAATGATTCTTATTTAAATATTAATCTATTATAAATATAAATAAATAA
ATAAATTAATTGTTTATA>TAATTan>ATAAAAATTAATTn>AATTan>ATTATGGAAATATATATATA
TATATATATATAATTAAAATTAATATATTAATAGAAAAAATAATTan>ATTn>AATATTTATA>TA
ATA
TATAAAATATATTATTCTAATATTAAAATATTAATAAAATAAAAAATAATTTTTAAT
AATAan>ATAan>ATA
TTAATAan>ATA>TAATATTAATATTTAATAan>ATTTCTTATATAAATAATTan>ATAA
AATTATTn>AATTan>ATAGAAAATAAATATAAATATTTTATTCCATATTTATAACTATTATTTC
TCATTTATAACATAATTn>AATA>TTATTan>ATTn>AATATTAATTC
w3c xhtml validator w3c css validator