S.cerevisiae - Yeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

YNCQ0021W

Promoter Sequence

Consensus
WTAWTW: -996 -980 -967 -876 -867 -862 -854 -851 -842 -835 -830 -827 -810 -807 -796 -793 -790 -771 -768 -765 -727 -721 -680 -675 -672 -652 -647 -639 -636 -623 -620 -525 -520 -517 -514 -506 -503 -478 -461 -457 -452 -445 -440 -391 -388 -382 -379 -374 -346 -343 -340 -334 -328 -322 -318 -314 -310 -299 -296 -289 -278 -240 -225 -176 -167 -164 -156 -152 -139 -130 -116 -106 -98 -94 -90 -42 -38 -34 -30 -23 -7

>YNCQ0021W    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TTTTATATTTATAAATAAATTTATTACTCCTTCTTAATTAAGAATAAAAAGGGATGCGGT
TCCCATGGGGTCCCGCACTCCTTCGGGGTCCGCCCCCTCCCCTGCGGGAGGGGAGCGGAC
TATTTTATTAAAAATATTA>TAATTAAATAATAan>ATATAAATAATTTATAATA>TAATAan>ATAT
ATACTTATAAATAATAan>TTTAAATCTTATTAan>TTAan>ATTTATAAATCATAAATTATTAan>TTAan>AT
AAATATCTCTTTTAGATAAGATAAATTGAACTTATATTTATATTATATATATATAGATAT
AAATCTTAAATAGAGTAAATATATTA>TAATAan>ATTATATAAATATATATATATTA>TATTAA
GATAATAan>ATATATATATATATTAan>ATATATAAGGAGGGATTTTCAATGTTGGTAGTTGGAG
TTGAGCTGTAAACTCAATGACTTAGGTCTTCATAGGTTCAATTCCTATTCCCTTCATAAT
T>TATTAan>TTAan>ATTATATATTAan>TTATAAATCAAATCCATTGAAATTAATATAATCCAATGAA
TAATTn>AATT>TAATACATAATT>TAATATATAAAATTATATATATATATACTTTATAAAAAA
AAAAATTATATAATAan>ATTATATTAan>ATA>TATTTATATATATAAATAAATAAATAAATAATA
>ATAan>ATTATAATTATAATTATAATTn>AATTn>AATTn>AATAAATAAATAATAan>ATTTATATTATCT
TTATAATATATATATATACTTTTATAAAAAAAATATATAAATAATTCTAAAATGTATATT
TCTCCTTTCGGGGTTCCGGCTCCCGTGGCCGGGCCCCGGAACTATTAATAAAATTAATAan>A
TAAAATAATTn>ATTATCTGTATTTAATAAATTTAATTATAGAGTTATATTTCTATATATTT
ATATATTTn>ATTTn>ATTTATTCTCCTTCCGGAACTAATAAAATATATAAAATAAGGGTTTTT
ATTTn>ATTTn>AATTn>AATATATATTTATTCTTTTATATAATAT

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
WTAWTW: 0 -23 -26 -48 -57 -62 -122 -132 -145 -148 -152 -157 -160 -163 -169 -172 -236 -244 -271 -282 -292 -295 -299 -303 -306 -310 -314 -320 -326 -332 -336 -339 -342 -346 -350 -354 -372 -375 -380 -384 -391 -423 -433 -453 -471 -474 -496 -499 -506 -510 -513 -613 -616 -629 -632 -640 -645 -656 -664 -668 -673 -678 -714 -754 -758 -761 -764 -767 -786 -789 -803 -806 -820 -823 -828 -838 -844 -847 -850 -854 -860 -863 -869 -959 -982

>YNCQ0021W	Upstream Sequence Complementary Strand
AAAATATAAATATTTATTTAAATAATGAGGAAGAATTAATTCTTATTTTTCCCTACGCCA
AGGGTACCCCAGGGCGTGAGGAAGCCCCAGGCGGGGGAGGGGACGCCCTCCCCTCGCCTG
ATAAAATAATTTTTATAan>ATATTAATTn>TATTan>ATTan>ATATTTATTAAATATTATA>TTATTan>ATA
TATGAATATTTATTan>ATAAATTTAGAATAATAan>ATTAAATATTTAGTATTTAATAan>ATAan>ATTan>A
TTn>TATAGAGAAAATCTATTCTATTTAACTTGAATATAAATATAATATATATATATCTATA
TTTAGAATTTATCTCATTTATA>TAATA>TTATTn>AATATATTTATATATATATAATA>TAATT
CTATTATTan>ATATATATATATAATTan>ATATATTCCTCCCTAAAAGTTACAACCATCAACCTC
AACTCGACATTTGAGTTACTGAATCCAGAAGTATCCAAGTTAAGGATAAGGGAAGTATTA
AATAATAan>ATTn>AATATATAATAan>ATATTTAGTTTAGGTAACTTTAATTan>ATATTAGGTTACTT
ATTAATTAAATTATGTATTAAATTATATATTTTAATATATATATATATGAAATATTTTTT
TTTTTAATATATTATTn>AATA>TAATTan>ATATAAATATATATATTTATTn>TATTn>TATTn>TATTan>AT
TATTn>AATATTAATATTAATATTAATTn>AATTn>AATTan>ATTn>TATTn>TATTan>ATTAAATATAATAGA
AATATTATATATATATATGAAAATATTTTTTTTATATATTTATTAAGATTTTACATATAA
AGAGGAAAGCCCCAAGGCCGAGGGCACCGGCCCGGGGCCTTGATAATTan>ATTTTAATTan>ATT
>ATT>TTATTn>AATAan>ATAGACATAAATTATTTAAATTAATATCTCAATATAAAGATATATAAA
TATATAAATAAATAAATAAGAGGAAGGCCTTGATTATT>TTATATATTTTATTCCCAAAAA
TAAATAAATTAATTan>ATATATAAATAAGAAAATATATTATA