S.cerevisiae - Yeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

YNCQ0020W

Promoter Sequence

Consensus
WTAWTW: -1000 -935 -905 -899 -892 -883 -880 -848 -837 -832 -829 -822 -795 -789 -784 -775 -770 -762 -755 -750 -747 -740 -736 -718 -708 -705 -702 -690 -680 -677 -656 -590 -577 -553 -548 -545 -542 -539 -536 -521 -491 -487 -483 -476 -428 -425 -422 -416 -412 -405 -402 -398 -395 -387 -371 -358 -267 -258 -253 -245 -242 -233 -226 -221 -218 -201 -198 -187 -184 -181 -162 -159 -156 -118 -112 -71 -66 -63 -43 -38 -30 -27 -14 -11

>YNCQ0020W    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
ATAATATAAATATAAATATAATGGGGTTATAGTTAAATTTGGTAGAACGACTGCGTTGCA
TGCATTTAATATGAGTTCAAGTCTCATTAACTCCAATAATTATATTATATAATATATATA
TTAan>ATAAATTATATATATATATATATATATAAATATTAAATAAATATTA>TATTAan>ATAAAT
AATATAAATTATCTAATCGAAGGAGATATTTATAATA>TAATATAAATATTT>TAATAAATT
AATAAATATTA>TATTAan>ATAAATAATTn>AATAAATATATAAATTATAATAAATTTTAATAan>TT
ATTATATAAATTAATTAAATATAATAan>ATTAATGAAATAGAAACTATAATTCAATTGGTTA
GAATAGTATTTTGATAAGGTACAAATATAGGTTCAATCCCTGTTAGTTTCATATTATATA
TCATTAATATATAAAATATAAATATATATATTA>TAATAan>ATAan>ATAan>ATAan>ATAAATATAAATA
TAATTATATATATATATATATATAAATAAATAATTn>ATTTn>AATTTATAATAAATATATATA
GTTCCCGCGAAGCGGGAACCCCATAAGGAGTTTTATTAan>TTAan>ATTATATTTn>AATAAATATT
AATTn>ATTAan>ATTTTATATTTATAAATAAATTTATTACTCCTTCTTAATTAAGAATAAAAAG
GGATGCGGTTCCCATGGGGTCCCGCACTCCTTCGGGGTCCGCCCCCTCCCCTGCGGGAGG
GGAGCGGACTATTTTATTAAAAATATTA>TAATTAAATAATAan>ATATAAATAATTTATAATA
</span>TAATAan>ATATATACTTATAAATAATAan>TTTAAATCTTATTAan>TTAan>ATTTATAAATCATAAATT
ATTAan>TTAan>ATAAATATCTCTTTTAGATAAGATAAATTGAACTTATATTTATATTATATATA
TATAGATATAAATCTTAAATAGAGTAAATATATTA>TAATAan>ATTATATAAATATATATATA
TTA>TATTAAGATAATAan>ATATATATATATATTAan>ATATATAA

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
WTAWTW: -4 -7 -20 -23 -31 -36 -47 -55 -59 -64 -69 -105 -145 -149 -152 -155 -158 -177 -180 -194 -197 -211 -214 -219 -229 -235 -238 -241 -245 -251 -254 -260 -350 -373 -391 -394 -398 -401 -405 -414 -418 -421 -465 -469 -483 -487 -491 -513 -519 -525 -529 -532 -535 -538 -541 -546 -555 -561 -570 -583 -612 -669 -673 -678 -682 -686 -695 -698 -701 -711 -716 -725 -729 -732 -736 -740 -743 -748 -751 -755 -758 -763 -771 -777 -782 -808 -815 -818 -822 -825 -830 -833 -837 -841 -844 -868 -873 -876 -885 -892 -897 -928 -981 -987 -993

>YNCQ0020W	Upstream Sequence Complementary Strand
TATTATATTTATATTTATATTACCCCAATATCAATTTAAACCATCTTGCTGACGCAACGT
ACGTAAATTATACTCAAGTTCAGAGTAATTGAGGTTATTAATA>TAATATATTATATATAT
AATTan>ATT>TAATATATATATATATATATATATTTATAan>ATTn>TATTn>TATAan>ATA>TAATTan>ATTn>TA
TTATATTTAATAGATTAGCTTCCTCTATAAATATTATA>TTATATTTATAAAATTATT>TAA
TTATTn>TATAan>ATA>TAATTan>ATTn>TATTn>AATTan>ATTn>TATATATTTAATA>TTATTTAAAATTATAan>A
TAATATATTTAATTn>AATTn>TATA>TTATTn>AATTACTTTATCTTTGATATTAAGTTAACCAAT
CTTATCATAAAACTATTCCATGTTTATATCCAAGTTAGGGACAATCAAAGTATAATATAT
AGTAATTATATATTTTATATTTATATATATAATA>TTATTan>ATTan>ATTan>ATTan>ATTn>TATATTTAT
ATTAATATATATATATATATATATTTATTn>TATTn>AATAAATTAAATATTATTn>TATATATAT
CAAGGGCGCTTCGCCCTTGGGGTATTCCTCAAAATAATAan>ATTn>AATATAAATTATTn>TATAan>A
TTn>AATAan>ATTAAAATATAAATATTTATTTAAATAATGAGGAAGAATTAATTCTTATTTTTC
CCTACGCCAAGGGTACCCCAGGGCGTGAGGAAGCCCCAGGCGGGGGAGGGGACGCCCTCC
CCTCGCCTGATAAAATAATTTTTATAan>ATATTAATTn>TATTan>ATTan>ATATTTATTAAATATTAT
A>TTATTan>ATATATGAATATTTATTan>ATAAATTTAGAATAATAan>ATTAAATATTTAGTATTTAA
TAATAan>ATTan>ATTn>TATAGAGAAAATCTATTCTATTTAACTTGAATATAAATATAATATATAT
ATATCTATATTTAGAATTTATCTCATTTATA>TAATA>TTATTn>AATATATTTATATATATAT
AATA>TAATTCTATTATTan>ATATATATATATAATTan>ATATATT