Yeastract
Please fill in here our
user satisfaction survey
Thank you!
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Search by DNA motif > Result > View in Promoter Contact/Credits     Tutorial     Help

 

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name YNCQ0019W
Promoter Sequence

Consensus
WTAWTW: -996 -993 -988 -984 -981 -976 -967 -933 -886 -867 -851 -807 -802 -797 -790 -787 -780 -777 -770 -767 -764 -760 -755 -751 -747 -743 -740 -727 -723 -675 -665 -660 -656 -648 -645 -641 -638 -634 -630 -627 -623 -605 -597 -592 -581 -577 -573 -569 -566 -556 -548 -545 -540 -529 -511 -508 -504 -492 -489 -472 -465 -460 -448 -438 -433 -429 -405 -402 -397 -394 -391 -384 -369 -366 -359 -353 -338 -273 -243 -237 -230 -221 -218 -186 -175 -170 -167 -160 -133 -127 -122 -113 -108 -100 -93 -88 -85 -78 -74 -56 -46 -43 -40 -28 -18 -15
>YNCQ0019W    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TAATTTATTAan>ATT>TATTTn>ATTAan>TTA>TATTTTTTTTAATAAAGGAAAATTAACTATAGGTA
AAGTGGATTATTTGCTAAGTAATTGAATTGTAAATTCTTATGAGTTCGAATCTCATATTT
TCCGTATATATCTTTAATTTAATGGTAAAATATTAGAATACGAATCTAATTATATAGGTT
CAAATCCTATAAGATATTA>TATTA>TATTATATAATAan>TTATATATTAan>ATAAATATTAan>TTAan>A
TTn>AATT>TATTTn>ATTTn>ATTTn>ATTAan>TTA
AATAAAAATATTTn>AATAGTTCCGGGGCCCGGCCA
CGGGAGCCGGAACCCCGAAAGGAGAATAATATAAAATATTA>TAATTn>ATTTATATATTAan>AT
TATTAan>ATTn>ATTTn>ATTAan>TTTn>ATTA
TATAAAAAGTATATAATTTTATATTT>TAATATAGGGT
TAATTn>AATTn>AATTn>ATTAan>ATT
TTTTATAATAAGATAATAan>ATA>TATTAAAAACTTATTATAA
ATTTATAAAATAATAan>TTTn>ATTTACTTTGATATTAan>TTTTTAATCTTTCATTAATATATATT
T>TATTA
TAAGTAATAATATAGTTTAATT>TAATTn>AATATAAATAAATTACATAAGAATAAT
ATTA>TAATAan>ATAan>TTA
TATATTATATAAAGAAATAATAan>ATTTATATTTTTATTTTTTTTAT
AAATAATATAAATATAAATATAATGGGGTTATAGTTAAATTTGGTAGAACGACTGCGTTG
CATGCATTTAATATGAGTTCAAGTCTCATTAACTCCAATAATTATATTATATAATATATA
TATTAan>ATA
AATTATATATATATATATATATATAAATATTAAATAAATATTA>TATTAan>ATAA
ATAATATAAATTATCTAATCGAAGGAGATATTTATAATA>TAATATAAATATTT>TAATAAA
TTAATAAATATTA>TATTAan>ATAAATAATTn>AATAAATATATAAATTATAATAAATTTTAATA
>
TTAan>TTATATAAATTAATTAAATATAATAan>ATTAATGAAATA
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
WTAWTW: -7 -11 -16 -20 -24 -33 -36 -39 -49 -54 -63 -67 -70 -74 -78 -81 -86 -89 -93 -96 -101 -109 -115 -120 -146 -153 -156 -160 -163 -168 -171 -175 -179 -182 -206 -211 -214 -223 -230 -235 -266 -319 -325 -331 -334 -362 -365 -377 -384 -387 -390 -395 -398 -416 -422 -425 -441 -444 -453 -465 -485 -504 -507 -522 -533 -538 -541 -549 -562 -565 -569 -573 -585 -616 -623 -630 -634 -637 -641 -652 -658 -661 -668 -723 -729 -733 -736 -756 -760 -763 -766 -770 -773 -780 -783 -790 -795 -800 -827 -847 -949 -960 -974 -977 -989
>YNCQ0019W	Upstream Sequence Complementary Strand
ATTAAATAATTAAATAAATAATAan>ATATAAAAAAAATTATTTCCTTTTAATTGATATCCAT
TTCACCTAATAAACGATTCATTAACTTAACATTTAAGAATACTCAAGCTTAGAGTATAAA
AGGCATATATAGAAATTAAATTACCATTTTATAATCTTATGCTTAGATTAATATATCCAA
GTTTAGGATATTCTATAATA>TAATA>TAATATATTATAan>ATATATAATTan>ATTn>TATAan>ATAan>ATT
AATT
AAATAAATAAATAAATAATAan>ATTn>TATTTTTATAAATTATCAAGGCCCCGGGCCGGT
GCCCTCGGCCTTGGGGCTTTCCTCTTATTATATTTTATAan>ATATTAATAAATATATAATTn>A
ATAan>ATTn>AATA
AATAATAAATAATATATTTTTCATATATTAAAATATAAAATTATATCCCA
ATTAATTn>AATTn>AATAan>ATTAAAAAATATTATTCTATTATTan>ATA>TAATTTTTGAATAATATT
TAAATATTTTATTan>ATAAATAAATGAAACTATAATAAAAATTAGAAAGTAATTATATATAA
AATAATATTCATTATTan>ATATCAAATTAAATTAATTan>ATATTTATTTAATGTATTCTTATTA
TAATA>TTATTan>ATAan>ATA
TATAATATATTTCTTTATTan>ATTAAATATAAAAATAAAAAAAATA
TTTATTan>ATATTTATATTTATATTACCCCAATATCAATTTAAACCATCTTGCTGACGCAAC
GTACGTAAATTATACTCAAGTTCAGAGTAATTGAGGTTATTAATA>TAATATATTATATAT
ATAATTan>ATT>TAATATATATATATATATATATATTTATAan>ATTn>TATTn>TATAan>ATA>TAATTan>ATT
TATTan>ATA
TTTAATAGATTAGCTTCCTCTATAAATATTATA>TTATATTTATAAAATTATT>T
AATTan>ATTn>TATAan>ATA>TAATTan>ATTn>TATTn>AATTan>ATTn>TATA
TATTTAATA>TTATTTAAAATTAT
AATAan>ATA
TATTTAATTn>AATTn>TATA>TTATTn>AATTACTTTAT
w3c xhtml validator w3c css validator