S.cerevisiae - Yeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

YNCQ0018W

Promoter Sequence

Consensus
WTAWTW: -990 -987 -983 -972 -967 -962 -952 -947 -942 -937 -932 -927 -924 -921 -918 -915 -912 -906 -900 -893 -889 -873 -865 -860 -857 -853 -846 -837 -832 -819 -815 -811 -807 -800 -797 -749 -737 -731 -726 -721 -716 -713 -708 -705 -700 -697 -692 -688 -685 -680 -677 -672 -668 -665 -660 -651 -617 -570 -551 -535 -491 -486 -481 -474 -471 -464 -461 -454 -451 -448 -444 -439 -435 -431 -427 -424 -411 -407 -359 -349 -344 -340 -332 -329 -325 -322 -318 -314 -311 -307 -289 -281 -276 -265 -261 -257 -253 -250 -240 -232 -229 -224 -213 -195 -192 -188 -176 -173 -156 -149 -144 -132 -122 -117 -113 -89 -86 -81 -78 -75 -68 -53 -50 -43 -37 -22

>YNCQ0018W    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
ATTTATAATCTTATTAan>ATTn>AATTAGATTATATTA>TATTA>TATTAGATCATATTA>TATTA>T
ATTA>TATTA>TATTA>TATTAan>TTAan>TTAan>TTAan>ATAan>TTTTTATTTTTATTTTATATTTn>AATAGTA
AAAAATCATAATTTTATAATT>TATTAan>ATTn>ATTATATAATTTCATTAATA>TATTTCTTCTT
TTTATTTn>ATTTn>ATTTn>ATTACTTATTAan>ATAGTTCCGGGGCCCGGCCACGGGAGCCGGAACC
CCGAAAGGAAAATAATATAAAAAATAATTATAATT>TATTA>TAATT>TATTAan>ATT>TATTAan>AT
T>TATTAan>ATT>TATTTn>ATTAan>ATT>TATTAan>ATT>TATTTn>ATTAan>TTA>TATTTTTTTTAATAAAGGA
AAATTAACTATAGGTAAAGTGGATTATTTGCTAAGTAATTGAATTGTAAATTCTTATGAG
TTCGAATCTCATATTTTCCGTATATATCTTTAATTTAATGGTAAAATATTAGAATACGAA
TCTAATTATATAGGTTCAAATCCTATAAGATATTA>TATTA>TATTATATAATAan>TTATATAT
TAATAAATATTAan>TTAan>ATTn>AATT>TATTTn>ATTTn>ATTTn>ATTAan>TTAAATAAAAATATTTn>AATAG
TTCCGGGGCCCGGCCACGGGAGCCGGAACCCCGAAAGGAGAATAATATAAAATATTA>TAA
TTn>ATTTATATATTAan>ATTn>ATTAan>ATTn>ATTTn>ATTAan>TTTn>ATTATATAAAAAGTATATAATTTTA
TATTT>TAATATAGGGTTAATTn>AATTn>AATTn>ATTAan>ATTTTTTATAATAAGATAATAan>ATA>TAT
TAAAAACTTATTATAAATTTATAAAATAATAan>TTTn>ATTTACTTTGATATTAan>TTTTTAATCT
TTCATTAATATATATTT>TATTATAAGTAATAATATAGTTTAATT>TAATTn>AATATAAATAA
ATTACATAAGAATAATAan>TTA>TAATAan>ATAan>TTATATATTATATAAAGAAATAATAan>ATTTATA
TTTTTATTTTTTTTATAAATAATATAAATATAAATATAAT

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
WTAWTW: -3 -9 -15 -18 -46 -49 -61 -68 -71 -74 -79 -82 -100 -106 -109 -125 -128 -137 -149 -169 -188 -191 -206 -217 -222 -225 -233 -246 -249 -253 -257 -269 -300 -307 -314 -318 -321 -325 -336 -342 -345 -352 -407 -413 -417 -420 -440 -444 -447 -450 -454 -457 -464 -467 -474 -479 -484 -511 -531 -633 -644 -658 -661 -673 -681 -693 -701 -709 -719 -729 -733 -742 -745 -793 -830 -846 -849 -853 -908 -911 -914 -917 -920 -925 -930 -935 -940 -945 -960 -965 -979 -983

>YNCQ0018W	Upstream Sequence Complementary Strand
TAAATATTAGAATAATTn>AATTAATCTAATATAATA>TAATATAATCTAGTATAATA>TAATA
</span>TAATA>TAATA>TAATA>TAATAan>ATAan>ATAan>ATTan>ATAAAAATAAAAATAAAATATAAATTATCAT
TTTTTAGTATTAAAATATTAAATAATTn>AATAan>ATATATTAAAGTAATTATATAAAGAAGAA
AAATAAATAAATAAATAATGAATAATTATCAAGGCCCCGGGCCGGTGCCCTCGGCCTTGG
GGCTTTCCTTTTATTan>ATATTTTTTATTn>AATATTAAATAATATTAAATAATTAAATAATTA
AATAATTAAATAAATAATTAAATAATTAAATAAATAATAan>ATATAAAAAAAATTATTTCCT
TTTAATTGATATCCATTTCACCTAATAAACGATTCATTAACTTAACATTTAAGAATACTC
AAGCTTAGAGTATAAAAGGCATATATAGAAATTAAATTACCATTTTATAATCTTATGCTT
AGATTAATATATCCAAGTTTAGGATATTCTATAATA>TAATA>TAATATATTATAan>ATATATA
ATTan>ATTn>TATAan>ATAan>ATTn>AATTAAATAAATAAATAAATAATAan>ATTn>TATTTTTATAAATTATC
AAGGCCCCGGGCCGGTGCCCTCGGCCTTGGGGCTTTCCTCTTATTATATTTTATAan>ATATT
AATAAATATATAATTn>AATAan>ATTn>AATAAATAATAAATAATATATTTTTCATATATTAAAAT
ATAAAATTATATCCCAATTAATTn>AATTn>AATAan>ATTAAAAAATATTATTCTATTATTan>ATA>TA
ATTTTTGAATAATATTTAAATATTTTATTan>ATAAATAAATGAAACTATAATAAAAATTAGA
AAGTAATTATATATAAAATAATATTCATTATTan>ATATCAAATTAAATTAATTan>ATATTTATT
TAATGTATTCTTATTATAan>ATA>TTATTan>ATAan>ATATATAATATATTTCTTTATTan>ATTAAATAT
AAAAATAAAAAAAATATTTATTan>ATATTTATATTTATATTA