S.cerevisiae - Yeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

YNCQ0017W

Promoter Sequence

Consensus
WTAWTW: -992 -989 -986 -983 -980 -956 -894 -884 -866 -853 -850 -845 -841 -838 -835 -827 -819 -816 -813 -810 -803 -800 -797 -783 -779 -760 -756 -751 -748 -745 -742 -739 -735 -732 -725 -700 -695 -690 -599 -591 -587 -584 -581 -578 -574 -557 -554 -540 -536 -527 -520 -505 -485 -464 -457 -454 -445 -433 -430 -426 -415 -410 -405 -395 -390 -385 -380 -375 -370 -367 -364 -361 -358 -355 -349 -343 -336 -332 -316 -308 -303 -300 -296 -289 -280 -275 -262 -258 -254 -250 -243 -240 -192 -180 -174 -169 -164 -159 -156 -151 -148 -143 -140 -135 -131 -128 -123 -120 -115 -111 -108 -103 -94 -60 -13

>YNCQ0017W    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
ATGGAGTAATAATAan>ATAan>ATAan>ATAan>ATAAAATAAAGGATCTGTAGCTTAATAGTAAAGTACC
ATTTTGTCATAATGGAGGATGTCAGTGCAAATCTGATTAGATTCGTATATTTATACTTAA
TATAAAAAAAATAAATAATAATCTTTTTTATTAan>TTA>TATTTn>ATTAan>ATAan>ATAAATTATTTT
GTTATTAan>TTAan>TTAan>ATTTATATTAan>ATAan>TTTTATATAAATTATTTn>ATTTAATCTTTCATTAT
ATATTTn>AATA>TATTAan>TTAan>ATAan>TTAan>ATTn>AATAan>TTTTATAATAAATAAATAAAATAAAATAA
ATATTT>TAATA>TAATACTCCTTCGGGGTTCGGTCCCCCTCCCATTAGTATAGTATAGGGA
GGGGTCCCTCACTCCTTCGGGGTCCCCGCCGGGGCGGGGACTTATTTTTATATTTn>ATTAan>A
TAATAan>ATTn>AATTTTTATATAAATTTATTAan>TTTCTTACAATATATTTn>ATTACTATTATTTT
TTAATAATCTTATATATAATATATAAAATATATATATATTATATATATATATAAATATAA
TATATATTAan>TTATAAATATTTATAATCTTATTAan>ATTn>AATTAGATTATATTA>TATTA>TATT
AGATCATATTA>TATTA>TATTA>TATTA>TATTA>TATTAan>TTAan>TTAan>TTAan>ATAan>TTTTTATTTTTA
TTTTATATTTn>AATAGTAAAAAATCATAATTTTATAATT>TATTAan>ATTn>ATTATATAATTTCA
TTAATA>TATTTCTTCTTTTTATTTn>ATTTn>ATTTn>ATTACTTATTAan>ATAGTTCCGGGGCCCGG
CCACGGGAGCCGGAACCCCGAAAGGAAAATAATATAAAAAATAATTATAATT>TATTA>TAA
TT>TATTAan>ATT>TATTAan>ATT>TATTAan>ATT>TATTTn>ATTAan>ATT>TATTAan>ATT>TATTTn>ATTAan>TTA>TA
TTTTTTTTAATAAAGGAAAATTAACTATAGGTAAAGTGGATTATTTGCTAAGTAATTGAA
TTGTAAATTCTTATGAGTTCGAATCTCATATTTTCCGTAT

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
WTAWTW: -76 -87 -101 -104 -116 -124 -136 -144 -152 -162 -172 -176 -185 -188 -236 -273 -289 -292 -296 -351 -354 -357 -360 -363 -368 -373 -378 -383 -388 -403 -408 -422 -426 -441 -447 -450 -457 -462 -478 -489 -498 -513 -523 -550 -570 -574 -577 -580 -688 -696 -700 -705 -710 -714 -718 -728 -731 -735 -738 -741 -744 -749 -779 -793 -796 -806 -809 -812 -823 -828 -831 -834 -843 -846 -859 -862 -866 -877 -968 -973 -976 -979 -982 -985 -988

>YNCQ0017W	Upstream Sequence Complementary Strand
TACCTCATTATTan>ATTan>ATTan>ATTan>ATTan>ATT>TTATTTCCTAGACATCGAATTATCATTTCATGG
TAAAACAGTATTACCTCCTACAGTCACGTTTAGACTAATCTAAGCATATAAATATGAATT
ATATTTTTTTTATTn>TATTan>ATTAGAAAAAATAATAan>ATATAAATAATTan>ATTan>ATT>TAATAAAA
CAATAATAan>ATAan>ATTAAATATAATTan>ATAAAATATATTTAATAAATAAATTAGAAAGTAATA
TATAAATTATA>TAATAan>ATTan>ATAan>ATTn>AATTan>ATAAAATATTATTn>TATTn>TATT>TTATT>TTATT
TATAAAATTATATTATGAGGAAGCCCCAAGCCAGGGGGAGGGTAATCATATCATATCCCT
CCCCAGGGAGTGAGGAAGCCCCAGGGGCGGCCCCGCCCCTGAATAAAAATATAAATAATT
>ATTan>ATTn>AATTAAAAATATATTTAAATAATAAAGAATGTTATATAAATAATGATAATAAAA
AATTATTAGAATATATATTATATATTTTATATATATATAATATATATATATATTTATA>TT
ATATATAATAan>ATATTTATAAATATTAGAATAATTn>AATTAATCTAATATAATA>TAATATAA
TCTAGTATAATA>TAATA>TAATA>TAATA>TAATA>TAATAan>ATAan>ATAan>ATTan>ATAAAAATAAAAAT
AAAATATAAATTATCATTTTTTAGTATTAAAATATTAAATAATTn>AATAan>ATATATTAAAGT
AATTATATAAAGAAGAAAAATAAATAAATAAATAATGAATAATTATCAAGGCCCCGGGCC
GGTGCCCTCGGCCTTGGGGCTTTCCTTTTATTan>ATATTTTTTATTn>AATATTAAATAATATT
AAATAATTAAATAATTAAATAATTAAATAAATAATTAAATAATTAAATAAATAATAan>ATAT
AAAAAAAATTATTTCCTTTTAATTGATATCCATTTCACCTAATAAACGATTCATTAACTT
AACATTTAAGAATACTCAAGCTTAGAGTATAAAAGGCATA