S.cerevisiae - Yeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

YNCQ0015W

Promoter Sequence

Consensus
WTAWTW: -988 -976 -973 -937 -932 -929 -908 -890 -878 -875 -863 -860 -857 -843 -785 -781 -778 -775 -765 -755 -751 -733 -721 -716 -711 -706 -703 -698 -695 -692 -677 -674 -671 -668 -665 -661 -655 -651 -648 -645 -642 -633 -619 -613 -610 -606 -603 -600 -597 -594 -589 -584 -581 -573 -564 -560 -557 -554 -549 -536 -521 -506 -501 -496 -483 -456 -431 -426 -423 -396 -393 -390 -383 -333 -328 -323 -318 -311 -265 -262 -234 -229 -225 -220 -195 -192 -185 -167 -164 -157 -153 -146 -141 -138 -135 -114 -111 -108 -103 -91 -88 -85 -79 -76 -54 -25 -22 -19 -16 -13

>YNCQ0015W    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
AATGGTTAAAGCATAATACTTCTAATATTAan>ATATTCCATGTTCAAATCATGGAGAGAGTA
ATTATATTA>TATTAan>ATAATCCCCCCCCCATTTTTAATTAAATTAAGAAGTTTAATTTACT
ATTTAATAan>ATAAATGAAATAATAan>ATAan>ATAGATATAAGTTAATTGGTAAACTGGATGTCTT
CCAAACATTGAATGCGAGTTCGATTCTCGCTATCTATAATTn>AATAan>TTAan>ATATAAATTAAT
ATCCTATAATTn>AATTAAATACAAAATTATATTAAAACTTATATTA>TATTA>TATTA>TAATA
>TTA>TATTAan>TTAan>TTATATAAAAATATAATAan>ATAan>ATAan>ATAan>TTTn>AATTTTATTTn>AATAan>ATAan>AT
ATTTTATATAATAAAATAATCATATTTATAATAan>TTTn>AATAan>TTAan>ATAan>ATAan>ATT>TATTA>TAA
TAATTCTTTAATATACTTATTTn>ATTAan>TTAan>TTT>TAATAAATAAATATAATTCTTATAAATA
TATTATAACAAAATATATTA>TATTT>TAATTAAATACAATATTATAAATATATATATATAT
ATAAATATTTATATAAAAAAAAAATAAAAATATTT>TAATAan>ATTATTCTTTATAAATAAAT
AATGATAATAan>ATAan>ATTTATAATAATCTCCTTGTGGGGTTCCGGCTCCCGTGGCCGGGCCC
CGGAACTATAATA>TATTT>TAATA>TATTTTTTATTACTCCTCCTTTGGGGTCCGCCCCGCG
GGGGCGGGGCGGACTATAATAan>ATTTTTTATTGATAAAAAAGTATATATAATA>TAATTn>AAT
A>TATTTCTTTTTATATAAATTATAAATATTAan>TTTTATAATAAAAAAAGTATATATAATAan>T
TATATATTTn>AATAAATAATA>TAATAan>ATAan>ATATAAATAAATATATATATATTAan>TTAan>ATA>TA
TTAAATTTTATAATAan>ATAan>ATTATAATAan>ATAGTAGTAGGTATAAATTTTAATAAAGAGTTT
TATTCCAATGGAGTAATAATAan>ATAan>ATAan>ATAan>ATAAAATAAA

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
WTAWTW: -1 -6 -9 -12 -15 -18 -21 -47 -72 -77 -81 -84 -96 -101 -104 -107 -118 -122 -128 -131 -134 -139 -142 -146 -157 -160 -178 -188 -191 -197 -218 -221 -227 -258 -316 -326 -376 -386 -389 -398 -402 -415 -419 -427 -433 -452 -470 -476 -488 -499 -504 -514 -519 -534 -538 -542 -550 -553 -566 -577 -582 -590 -593 -596 -599 -606 -621 -626 -638 -641 -644 -661 -664 -667 -670 -675 -685 -688 -691 -696 -699 -704 -709 -714 -726 -731 -743 -747 -758 -761 -768 -771 -774 -777 -853 -856 -859 -868 -871 -895 -900 -922 -925 -930 -935 -966 -969 -972

>YNCQ0015W	Upstream Sequence Complementary Strand
TTACCAATTTCGTATTATGAAGATTATAan>ATTan>ATAAGGTACAAGTTTAGTACCTCTCTCAT
TAATA>TAATA>TAATTan>ATTAGGGGGGGGGTAAAAATTAATT>TAATTCTTCAAATTAAATGA
TAAATTATTan>ATTTACTTTATTan>ATTan>ATTATCTATATTCAATTAACCATTTGACCTACAGAA
GGTTTGTAACTTACGCTCAAGCTAAGAGCGATAGATATTAATTan>ATAan>ATTan>ATATTTAATTan>A
TAGGATATTAATTn>AATTTATGTTTTAATA>TAATTTTGAATATAATA>TAATA>TAATA>TTAT
AATA>TAATAan>ATAan>ATATATTTTTATA>TTATTan>ATTan>ATTan>ATAAATTAAAATAAATTATTan>ATTan>A
TAAAATATATTATT>TTATTAGTATAAATATTATAAATTATAan>ATTan>ATTan>ATTAAATAATA>TT
ATTAAGAAATTATATGAATAAATAATAan>ATAAAATTATTn>TATTn>TATATTAAGAATATTTAT
A>TAATATTGTTTTATA>TAATATAAAATTAATTTATGTTATAATATTTATATATATATATA
TATTTATAAATATATTTTTTTTTTATTTTTATAAAATTATTn>AATAAGAAATATTTATTn>TA
TTACTATTATTan>ATTAAATATTATTAGAGGAACACCCCAAGGCCGAGGGCACCGGCCCGGG
GCCTTGATATTATATAAAATTATATAAAAAATAATGAGGAGGAAACCCCAGGCGGGGCGC
CCCCGCCCCGCCTGATATTATTAAAAAATAACTATTTTTTCATATATATTATATTAATTan>A
TATAAAGAAAAATATATTTAATATTTATAan>ATAAAATATTATTTTTTTCATATATATTATA
>ATATATAAATTATTn>TATTan>ATA>TTATTan>ATTan>ATATTTATTn>TATATATATATAATAan>ATTan>ATA>T
AATTTAAAATATTATTan>ATTn>AATA>TTATTATCATCATCCATATTTAAAATTATTTCTCAAA
ATAAGGTTACCTCATTATTan>ATTan>ATTan>ATTan>ATTan>ATT>TTATTT