Yeastract
Please fill in here our
user satisfaction survey
Thank you!
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Search by DNA motif > Result > View in Promoter Contact/Credits     Tutorial     Help

 

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name YNCQ0014W
Promoter Sequence

Consensus
WTAWTW: -1000 -993 -989 -979 -972 -969 -954 -950 -941 -915 -910 -905 -901 -896 -890 -879 -845 -832 -814 -811 -805 -800 -786 -767 -764 -755 -752 -748 -745 -742 -724 -698 -694 -689 -684 -680 -677 -670 -666 -663 -659 -656 -652 -649 -594 -552 -549 -545 -541 -537 -519 -514 -510 -479 -476 -473 -426 -336 -333 -320 -302 -299 -296 -286 -283 -280 -275 -259 -254 -251 -248 -245 -242 -239 -236 -233 -226 -223 -220 -216 -210 -207 -204 -201 -198 -193 -188 -184 -181 -174 -171 -134 -122 -119 -83 -78 -75 -54 -36 -24 -21 -9 -6
>YNCQ0014W    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
ATATTATATATTTn>ATTTATATATAATTCTTATTAan>ATTGAAAAAAGAATAATTn>AATAATCT
TATTA
AAAAAATAAATACTTTCATTTTATTT>TATTT>TATTTn>AATT>TAATTATAATATATA
AATATTAAAAAAAGGATATAAGTTTTTTATAAGATATAATATATATATATATTAAATATA
AAGAAGTTAATAan>TTTATATTT>TAATTATAAAATGTTAATACTCCTTTGGGGACTTATTAan>A
TT
AAATTATTAan>ATTn>AATAan>ATAan>ATTTATGATTTATAAATAATAAATAAAGGAATAAGTATC
AATTAATTn>AATA>TATTA>TATTTn>AATAan>TTTTATATTTn>AATAan>TTTn>AATAan>TTTn>AATAan>TTTTAA
GTTCCGGGGCCCGGCCACGGGAGCCGGAACCCCGAAAGGAGTAGTATTAATTATGGATAG
TGAGGGTGGATTTAATCCTTTTGTTATGTTATTAan>ATTn>AATTn>AATTn>AATTTATATATATAA
AATATTT>TAATTn>AATTTTTATATAAATATATATATATATATATATTAan>ATAan>ATAGTCCGGC
CCGCCCCGTGGGGCGGACCCCAAAGGAGTAATATATATTATGTATAAACAATAGAGAATA
TTGTTTAATGGTAAAACAGTTGTCTTTTAAGCAACCCATGCTTGGTTCAACTCCAGCTAT
TCTCATAATAan>TTATATATATATATTTCCCTTTCTAAAAATAATAan>ATAan>ATTATATATAATA
>
ATAan>ATA>TAATTATATATATATATATTA>TAATAan>ATAan>ATAan>ATAan>ATAan>ATAan>ATAan>ATAAATAATA
>
ATAan>ATTn>ATTTTTATTAan>ATAan>ATAan>TTAan>ATA>TATTA>TAATTn>ATTAan>ATAAATATTAan>ATAAAAAT
AGCTCTCTTAGCTTAATGGTTAAAGCATAATACTTCTAATATTAan>ATATTCCATGTTCAAA
TCATGGAGAGAGTAATTATATTA>TATTAan>ATAATCCCCCCCCCATTTTTAATTAAATTAAG
AAGTTTAATTTACTATTTAATAan>ATAAATGAAATAATAan>ATA
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
WTAWTW: -2 -5 -14 -17 -41 -46 -68 -71 -76 -81 -112 -115 -118 -164 -167 -170 -174 -177 -180 -186 -191 -194 -197 -200 -203 -212 -216 -219 -222 -226 -229 -232 -235 -238 -241 -244 -247 -252 -267 -273 -276 -279 -288 -292 -295 -298 -326 -329 -419 -426 -469 -472 -491 -506 -515 -533 -537 -541 -545 -586 -590 -645 -652 -659 -673 -682 -687 -690 -694 -713 -717 -720 -738 -741 -744 -748 -751 -756 -760 -792 -807 -821 -825 -838 -872 -875 -883 -888 -926 -934 -943 -946 -965 -993
>YNCQ0014W	Upstream Sequence Complementary Strand
TATAATATATAAATAAATATATATTAAGAATAATTAACTTTTTTCTTATTAATTan>ATTAGA
ATAATTTTTTTATTTATGAAAGTAAAATAAAATAAAATAAATTAAATTAATA>TTATATAT
TTATAan>ATT
TTTTTCCTATATTCAAAAAATATTCTATATTATATATATATATAATTn>TATAT
TTCTTCAATTATAAATATAAAATTAATATTTTACAATTATGAGGAAACCCCTGAATAATT
AATT>TAATAan>ATTn>AATTan>ATTan>ATT
AAATACTAAATATTTATTan>ATTn>TATTTCCTTATTCATAG
TTAATTn>AATTan>ATA>TAATATAAATTATAAAATATAAATTATAAATTATAAATTATAAAATT
CAAGGCCCCGGGCCGGTGCCCTCGGCCTTGGGGCTTTCCTCATCATAATTn>AATACCTATC
ACTCCCACCTAAATTAGGAAAACAATACAATAATTn>AATTn>AATTn>AATTAAATATATATATT
TTATA
AAATTAATTAAAAATATATTTATATATATATATATATATAATTan>ATTATCAGGCCG
GGCGGGGCACCCCGCCTGGGGTTTCCTCATTATATATAATACATATTTGTTATCTCTTAT
AACAAATTACCATTTTGTCAACAGAAAATTCGTTGGGTACGAACCAAGTTGAGGTCGATA
AGAGTATTATAan>ATATATATATATAAAGGGAAAGATTTTTATTan>ATTan>ATTn>AATATATATTAT
TATTan>ATA
TTAATATATATATATATAATA>TTATTan>ATTan>ATTan>ATTan>ATTan>ATTan>ATTan>ATTn>TATTan>AT
TATTn>AATA
AAAATAATTan>ATTan>ATAan>ATTan>ATA>TAATATTAATAan>ATTan>ATTn>TATAan>ATTan>ATTTTTA
TCGAGAGAATCGAATTACCAATTTCGTATTATGAAGATTATAan>ATTan>ATAAGGTACAAGTTT
AGTACCTCTCTCATTAATA>TAATA>TAATTan>ATTAGGGGGGGGGTAAAAATTAATT>TAATTC
TTCAAATTAAATGATAAATTATTan>ATTTACTTTATTan>ATTAT
w3c xhtml validator w3c css validator