S.cerevisiae - Yeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

YNCQ0013W

Promoter Sequence

Consensus
WTAWTW: -992 -972 -969 -965 -961 -958 -948 -928 -918 -915 -912 -909 -906 -897 -894 -891 -856 -851 -846 -841 -834 -830 -820 -813 -810 -795 -791 -782 -756 -751 -746 -742 -737 -731 -720 -686 -673 -655 -652 -646 -641 -627 -608 -605 -596 -593 -589 -586 -583 -565 -539 -535 -530 -525 -521 -518 -511 -507 -504 -500 -497 -493 -490 -435 -393 -390 -386 -382 -378 -360 -355 -351 -320 -317 -314 -267 -177 -174 -161 -143 -140 -137 -127 -124 -121 -116 -100 -95 -92 -89 -86 -83 -80 -77 -74 -67 -64 -61 -57 -51 -48 -45 -42 -39 -34 -29 -25 -22 -15 -12

>YNCQ0013W    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
ATAAATATATAATTATACTCCTATTTTTATATTAan>ATTn>AATTn>AATAan>ATATATGATAATATA
AAAATTATTGAATTATTAACTCTTATTAan>ATAan>ATAan>ATAan>ATAATCATAATAan>ATAan>ATATATAT
ATATATAGTATATATATAAAAGTTTTATTA>TATTA>TATTA>TATTATATATTTn>ATTTATAT
ATAATTCTTATTAan>ATTGAAAAAAGAATAATTn>AATAATCTTATTAAAAAAATAAATACTTT
CATTTTATTT>TATTT>TATTTn>AATT>TAATTATAATATATAAATATTAAAAAAAGGATATAA
GTTTTTTATAAGATATAATATATATATATATTAAATATAAAGAAGTTAATAan>TTTATATTT
</span>TAATTATAAAATGTTAATACTCCTTTGGGGACTTATTAan>ATTAAATTATTAan>ATTn>AATAan>ATA
>ATTTATGATTTATAAATAATAAATAAAGGAATAAGTATCAATTAATTn>AATA>TATTA>TATT
TAATAan>TTTTATATTTn>AATAan>TTTn>AATAan>TTTn>AATAan>TTTTAAGTTCCGGGGCCCGGCCACGGG
AGCCGGAACCCCGAAAGGAGTAGTATTAATTATGGATAGTGAGGGTGGATTTAATCCTTT
TGTTATGTTATTAan>ATTn>AATTn>AATTn>AATTTATATATATAAAATATTT>TAATTn>AATTTTTAT
ATAAATATATATATATATATATATTAan>ATAan>ATAGTCCGGCCCGCCCCGTGGGGCGGACCCC
AAAGGAGTAATATATATTATGTATAAACAATAGAGAATATTGTTTAATGGTAAAACAGTT
GTCTTTTAAGCAACCCATGCTTGGTTCAACTCCAGCTATTCTCATAATAan>TTATATATATA
TATTTCCCTTTCTAAAAATAATAan>ATAan>ATTATATATAATAan>ATAan>ATA>TAATTATATATATAT
ATATTA>TAATAan>ATAan>ATAan>ATAan>ATAan>ATAan>ATAan>ATAAATAATAan>ATAan>ATTn>ATTTTTATTAan>ATAan>AT
ATTAan>ATA>TATTA>TAATTn>ATTAan>ATAAATATTAan>ATAAAAATA

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
WTAWTW: -5 -8 -11 -15 -18 -21 -27 -32 -35 -38 -41 -44 -53 -57 -60 -63 -67 -70 -73 -76 -79 -82 -85 -88 -93 -108 -114 -117 -120 -129 -133 -136 -139 -167 -170 -260 -267 -310 -313 -332 -347 -356 -374 -378 -382 -386 -427 -431 -486 -493 -500 -514 -523 -528 -531 -535 -554 -558 -561 -579 -582 -585 -589 -592 -597 -601 -633 -648 -662 -666 -679 -713 -716 -724 -729 -767 -775 -784 -787 -806 -834 -839 -844 -849 -884 -887 -890 -899 -902 -905 -908 -911 -921 -924 -932 -941 -951 -954 -957 -961 -965 -984 -992

>YNCQ0013W	Upstream Sequence Complementary Strand
TATTTATATATTAATATGAGGATAAAAATATAATTn>AATTn>AATTan>ATTan>ATATACTATTATAT
TTTTAATAACTTAATAan>ATTGAGAATAATTan>ATTan>ATTan>ATTan>ATTAGTATTATTan>ATTan>ATATATA
TATATATCATATATATATTTTCAAAATAATA>TAATA>TAATA>TAATATATAAATAAATATA
TATTAAGAATAATTAACTTTTTTCTTATTAATTan>ATTAGAATAATTTTTTTATTTATGAAA
GTAAAATAAAATAAAATAAATTAAATTAATA>TTATATATTTATAan>ATTTTTTTCCTATATT
CAAAAAATATTCTATATTATATATATATATAATTn>TATATTTCTTCAATTATAAATATAAA
ATTAATATTTTACAATTATGAGGAAACCCCTGAATAATTn>AATT>TAATAan>ATTn>AATTan>ATTan>AT
TAAATACTAAATATTTATTan>ATTn>TATTTCCTTATTCATAGTTAATTn>AATTan>ATA>TAATATAA
ATTATAAAATATAAATTATAAATTATAAATTATAAAATTCAAGGCCCCGGGCCGGTGCCC
TCGGCCTTGGGGCTTTCCTCATCATAATTn>AATACCTATCACTCCCACCTAAATTAGGAAA
ACAATACAATAATTn>AATTn>AATTn>AATTAAATATATATATTTTATAAAATTAATTAAAAATA
TATTTATATATATATATATATATAATTan>ATTATCAGGCCGGGCGGGGCACCCCGCCTGGGG
TTTCCTCATTATATATAATACATATTTGTTATCTCTTATAACAAATTACCATTTTGTCAA
CAGAAAATTCGTTGGGTACGAACCAAGTTGAGGTCGATAAGAGTATTATAan>ATATATATAT
ATAAAGGGAAAGATTTTTATTan>ATTan>ATTn>AATATATATTATTan>ATTan>ATATTAATATATATATA
TATAATA>TTATTan>ATTan>ATTan>ATTan>ATTan>ATTan>ATTan>ATTn>TATTan>ATTan>ATTn>AATAAAAATAATTan>ATTan>A
TAATTan>ATA>TAATATTAATAan>ATTan>ATTn>TATAan>ATTan>ATTTTTAT