Yeastract
Please fill in here our
user satisfaction survey
Thank you!
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Search by DNA motif > Result > View in Promoter Contact/Credits     Tutorial     Help

 

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name YNCQ0008W
Promoter Sequence

Consensus
WTAWTW: -998 -993 -982 -979 -965 -962 -948 -942 -939 -936 -915 -912 -903 -900 -889 -861 -733 -722 -719 -716 -713 -709 -705 -698 -695 -691 -664 -661 -658 -652 -640 -628 -618 -614 -610 -602 -599 -596 -591 -587 -584 -577 -568 -559 -550 -542 -480 -477 -474 -466 -452 -449 -434 -431 -403 -400 -394 -372 -367 -351 -346 -343 -330 -281 -274 -271 -268 -265 -262 -259 -254 -251 -247 -242 -218 -215 -210 -207 -182 -179 -176 -171 -162 -159 -155 -146 -139 -133 -122 -118 -103 -91 -86 -82 -72 -68 -54 -51 -27
>YNCQ0008W    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
ATATATTA>TATTAAAAATATAATAan>ATTTATATGATTTATTAan>ATACTTTTTATATAATTAT
ATTAan>TTAan>TTT
TTTTTTATAGATGTTATATTAan>TTTTTTATAATAan>ATTTTTTTTTATTTAAA
TAAAATTTATAACTCCTTCTTAATTAAAGATAAAAGGGGTTCCCCCCTTAAGTATAAGTA
TAAGTATAAGTATAAGTATAAGTATAAGTATAAGTATAAGTATAAGTATAAGTATAGTAT
ACGGGGGGGGGGTCCCTCACTCCTTCGTTAATTTATATATATTAan>TTAan>ATAan>ATTn>ATTTn>AAT
T
TTTATTAan>TTTn>ATTTATATATAAAAATATTCTAAAATTATTAan>ATAan>TTTATAATAGAATAA
ATATTATAAAGTATAATTATAAATAATTn>AATTn>ATTTAAATAATAan>ATAan>ATA>TATTTn>ATTAan>T
TA
TATAATAAATATATTATAAATAATAGTTATATTAGCTTAATTGGTAGAGCATTCGTTT
TGTAATCGAAAGGTTTGGGGTTCAAATCCCTAATATAACAATAATAan>ATAan>ATAAAATATTA
AAATAAATATAATAan>TTTATAAAAAATTTATTAan>ATTTATATAAAAAATATATATATAAATA
ATAan>ATT
ATAATAAAACATTTTATAATCAATAATT>TAATAAATAATCTTCTTATTA>TAATA
>
TTATGTTTAAATATTACTCTTTATGAGGTCCAACAAACTAATAAGATATAAATATATATA
TATTA
TATAATAan>ATAan>ATAan>ATAan>ATAan>ATA>TATTAan>TTTn>AATA>TATTATCAAGAAGATAAATAT
AAATAATAan>TTT>TAATAan>ATTTTAAATAAATCTAATTTATATATTAan>ATAan>ATT>TAATAATCTT
AATAan>TTTn>ATTA
TCATTATTTCATATTTATATTATATAAATATTTn>ATTTAAATAAAAAATA
TTA
AAGAGTTTATTT>TATTTn>ATTATAAATTATTTn>AATAAAATATATATAATAan>ATATATAG
AATAAAGATATAAATAATTATAAGTATATAAAGTAATAAA
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
WTAWTW: -1 -19 -23 -44 -47 -56 -61 -68 -75 -96 -99 -106 -118 -126 -148 -155 -164 -172 -175 -193 -203 -211 -214 -220 -235 -240 -247 -252 -255 -258 -261 -264 -267 -274 -285 -296 -326 -336 -339 -344 -356 -360 -387 -392 -396 -399 -411 -427 -445 -450 -454 -459 -462 -467 -470 -473 -484 -555 -561 -566 -570 -577 -580 -589 -592 -595 -598 -606 -610 -614 -620 -633 -636 -654 -657 -660 -671 -691 -705 -709 -712 -715 -853 -877 -896 -908 -932 -935 -940 -958 -975 -980 -986 -991
>YNCQ0008W	Upstream Sequence Complementary Strand
TATATAATA>TAATTTTTATA>TTATTAAATATACTAAATAATTATGAAAAATATATTAATA
</span>TAATAan>ATAAAAAAAAATATCTACAATATAATAAAAAATATTATTAAAAAAAAATAAATTT
ATT
TTAAATATTGAGGAAGAATTAATTTCTATTTTCCCCAAGGGGGGAATTCATATTCAT
ATTCATATTCATATTCATATTCATATTCATATTCATATTCATATTCATATTCATATCATA
TGCCCCCCCCCCAGGGAGTGAGGAAGCAATTAAATATATATAATAan>ATTan>ATTn>AATAAATTA
AAAATAATAAATAAATATATATTTTTATAAGATTTTAATAan>ATTan>ATAAATATTATCTTATT
TATAan>ATA
TTTCATATTAATATTTATTn>AATTn>AATAAATTTATTan>ATTan>ATTan>ATATAAATAATA
>
ATA
TATTATTn>TATA>TAATATTTATTATCAATATAATCGAATTAACCATCTCGTAAGCAAA
ACATTAGCTTTCCAAACCCCAAGTTTAGGGATTATATTGTTATTATTan>ATTan>ATT>TTATAan>AT
T>TTATTn>TATA>TTATA
AATATTTTTTAAATAATTAAATATATTTTTTATATATATATTTAT
TATTn>AATA>TTATT
TTGTAAAATATTAGTTATTAAATTATTn>TATTAGAAGAATAATA>TTAT
AATA
CAAATTTATAATGAGAAATACTCCAGGTTGTTTGATTATTCTATATTTATATATAT
ATAATATATTATTan>ATTan>ATTan>ATTan>ATTan>ATA>TAATAAATTATA>TAATAGTTCTTCTATTTATA
TTTATTan>ATAAAATTATTAAAATTTATTTAGATTAAATATATAATTan>ATTAAATTATTAGAA
TTATA
AATAATAGTAATAAAGTATAAATATAATATATTTATAAATAAATTTATTTTTTAT
AATT
TCTCAAATAAAATAAATAATATTTAATAAATTATT>TTATATATATTATTan>ATATATC
TTATTTCTATATTTATTn>AATATTCATATATTTCATTATTT
w3c xhtml validator w3c css validator