S.cerevisiae - Yeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

YNCQ0007W

Promoter Sequence

Consensus
WTAWTW: -946 -938 -933 -928 -923 -919 -912 -899 -896 -893 -883 -876 -873 -870 -867 -860 -855 -852 -849 -829 -825 -821 -817 -813 -809 -806 -802 -798 -790 -786 -783 -779 -770 -763 -760 -757 -728 -723 -713 -708 -701 -695 -692 -684 -681 -678 -675 -657 -644 -635 -627 -617 -574 -571 -568 -565 -559 -550 -544 -541 -535 -510 -507 -453 -450 -445 -440 -429 -426 -412 -409 -395 -389 -386 -383 -362 -359 -350 -347 -336 -308 -180 -169 -166 -163 -160 -156 -152 -145 -142 -138 -111 -108 -105 -99 -87 -75 -65 -61 -57 -49 -46 -43 -38 -34 -31 -24 -15 -6

>YNCQ0007W    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
AGTTCCGGGGCCCGGCCACGGGAGCCGGAACCCCGAAAGGAGTTTATAAAAGATATATTT
TTATATTA>TATTA>TATTA>TATTTn>AATAAATATTACCTTTTTTTATTAan>TTAan>TTTTTATATA
TTATATAATAan>TTAan>TTAan>ATTTTTATTA>TAATAan>TTAan>TTTACTTTTTTATTGGATTATTTn>ATT
TATTTn>ATTTn>ATTTn>ATTAan>ATTn>AATTn>AATTAAATATTTn>ATTAan>ATTn>AATATATATATTAAATA
TTAan>ATAan>TTTCATTAAAAAAAAGAGATATATGAATAATA>TATTATGTTATATTA>TATTATA
TAATTATATTAan>TTTTTATAATAan>TTAan>ATAan>ATTAAAAATAAGAACTTATTTAAAAATTATAA
TTATGATAATAAATTAATACTTTTTAATTTATAAAAATATAAATTTCTTTACATATATAT
ATATATATATTAan>TTAan>TTAan>TTTATATTAATCATAATTTTAATAan>TTTATAATAAATTTATAT
AAAATCAATTATAATAan>TTATATACTTTTTATATACTTTATAATCTTTATATCTTCACCCC
CCCTTTTTTAATAan>ATA>TATTA>TATTAAAAATATAATAan>ATTTATATGATTTATTAan>ATACTT
TTTATATAATTATATTAan>TTAan>TTTTTTTTTATAGATGTTATATTAan>TTTTTTATAATAan>ATTT
TTTTTTATTTAAATAAAATTTATAACTCCTTCTTAATTAAAGATAAAAGGGGTTCCCCCC
TTAAGTATAAGTATAAGTATAAGTATAAGTATAAGTATAAGTATAAGTATAAGTATAAGT
ATAAGTATAGTATACGGGGGGGGGGTCCCTCACTCCTTCGTTAATTTATATATATTAan>TTA
>ATAan>ATTn>ATTTn>AATTTTTATTAan>TTTn>ATTTATATATAAAAATATTCTAAAATTATTAan>ATAan>TT
TATAATAGAATAAATATTATAAAGTATAATTATAAATAATTn>AATTn>ATTTAAATAATAan>ATA
>ATA>TATTTn>ATTAan>TTATATAATAAATATATTATAAATAATA

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
WTAWTW: -2 -8 -13 -17 -24 -27 -36 -39 -42 -45 -53 -57 -61 -67 -80 -83 -101 -104 -107 -118 -138 -152 -156 -159 -162 -300 -324 -343 -355 -379 -382 -387 -405 -422 -427 -433 -438 -443 -446 -500 -503 -508 -528 -537 -552 -561 -564 -567 -600 -623 -628 -636 -642 -661 -667 -671 -674 -677 -688 -693 -701 -706 -716 -721 -753 -756 -759 -763 -772 -775 -779 -786 -790 -794 -798 -802 -845 -848 -853 -863 -866 -869 -876 -889 -892 -908 -912 -921 -926 -931

>YNCQ0007W	Upstream Sequence Complementary Strand
TCAAGGCCCCGGGCCGGTGCCCTCGGCCTTGGGGCTTTCCTCAAATATTTTCTATATAAA
AATATAATA>TAATA>TAATATAAATTATTn>TATAATGGAAAAAAATAATAan>ATAAAAATATAT
AATATATTATAan>ATAan>ATTAAAAATAATA>TTATAan>ATAAATGAAAAAATAACCTAATAAATAA
ATAAATAAATAAATAATTn>AATTn>AATTn>AATTn>TATAAATAATTn>AATTan>ATATATATAATTn>TAT
AATTan>ATAAAGTAATTTTTTTTCTCTATATACTTATTATA>TAATACAATATAATA>TAATAT
ATTAATA>TAATAAAAATATTATAan>ATTan>ATTn>AATTTTTATTCTTGAATAAATTTTTAATATT
AATACTATTATT>TAATTATGAAAAATTAAATATTTTTATATTTAAAGAAATGTATATATA
TATATATATAATAan>ATAan>ATAAATATAATTAGTATTAAAATTATAAATATTATTTAAATATA
TTTTAGTTAATA>TTATAan>ATATATGAAAAATATATGAAATATTAGAAATATAGAAGTGGGG
GGGAAAAAATTATTan>ATA>TAATA>TAATTTTTATA>TTATTAAATATACTAAATAATTATGAA
AAATATATTAATA>TAATAan>ATAAAAAAAAATATCTACAATATAATAAAAAATATTATTAAA
AAAAAATAAATTTATTTTAAATATTGAGGAAGAATTAATTTCTATTTTCCCCAAGGGGGG
AATTCATATTCATATTCATATTCATATTCATATTCATATTCATATTCATATTCATATTCA
TATTCATATCATATGCCCCCCCCCCAGGGAGTGAGGAAGCAATTAAATATATATAATAan>AT
TATTn>AATAAATTAAAAATAATAAATAAATATATATTTTTATAAGATTTTAATAan>ATTan>ATAA
ATATTATCTTATTTATAan>ATATTTCATATTAATATTTATTn>AATTn>AATAAATTTATTan>ATTan>AT
TATATAAATAATAan>ATATATTATTn>TATA>TAATATTTATTAT