S.cerevisiae - Yeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

YNCQ0004W

Promoter Sequence

Consensus
WTAWTW: -990 -946 -942 -939 -935 -932 -906 -903 -895 -884 -879 -819 -816 -799 -796 -791 -788 -782 -768 -765 -762 -759 -753 -746 -734 -731 -726 -722 -718 -714 -710 -706 -702 -698 -694 -690 -686 -683 -657 -650 -621 -609 -597 -579 -575 -571 -554 -551 -544 -518 -513 -500 -476 -466 -460 -446 -443 -374 -371 -346 -337 -310 -301 -297 -293 -202 -184 -179 -174 -169 -164 -159 -154 -149 -144 -139 -134 -129 -125 -120 -114 -105 -92 -83 -80 -77 -74 -71 -68 -62 -54 -49 -46 -43 -40 -37 -34 -18 -15 -12

>YNCQ0004W    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TATTAAAAATATAATTAACAAGAATAAATAGTCCGTGGGATCGAACCCCCTTTTTTATTT
AATAan>TTTn>AATAan>TTTAAAGAAGGAATTGTTTATATATATTAan>ATATCTTATTTGGGGATTAA
TA>TAATATATAAGTTTTGGATACCAGGCCAAAGACCGGAATCCCAAAAGGAGATTATATA
AATATTAan>TTTATCTCCCTTTTTTAATAan>TTA>TAATAan>ATTTTATTAAAAATAAAATAATAan>AT
AATAan>ATTATAATTTATAATAACAATTATAATAan>ATT>TAATTn>AATTn>AATTn>AATTn>AATTn>AATT
AATTn>AATTn>AATTn>AATTn>AATAan>ATAAATATAAATATAAAAAGAATATAATTTATAATAAATA
AATTTATATATATATATATATATTAAATAAAATATTTACTTCATTAATATAAAATATAAA
TATATTTn>AATTn>AATAAGTATATATATATAATAan>ATATATAATAACCTATTTATATATATAA
TCTTAATA>TAATTATAAGAAATATTATATAAGTAATATATAAAAATAATATAAAATAATT
ATAATTCAATTTATATATTAan>ATAGTTCCGGGGCCCGGCCACGGGAGCCGGAACCCCGAAA
GGAGGAATAAGATAAATATATAAATTATATTAan>ATAAATATAAATTTTAAATGAATTAATA
AAATTAATATATATATGTATATATATATATATATTAAAAATATTTn>AATTn>ATTTTTAGGAA
GGAGTGATAGATCCCTTTGGGGGACCGAACCCCTATTTAAGAAGGAGTGCGGGACCCCGT
GGGAACCGAACCCCTTTTTTATTTAAAGAAGAAGTTTTATTT>TATTT>TATTT>TATTT>TAT
TT>TATTT>TATTT>TATTT>TATTT>TATTT>TATTT>TATTTn>AATT>TAATTTTAATTAGGTTAAT
AAATAGTAATAATAAACTTAATAan>ATAan>ATAan>ATAan>ATAan>ATTTTATTTTTATAATT>TATTAan>ATA
>ATAan>ATAan>ATAan>ATTATATATATATATATTAan>TTAan>ATAAATATA

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
WTAWTW: -1 -5 -8 -11 -26 -30 -33 -36 -39 -42 -64 -67 -70 -73 -76 -85 -88 -98 -289 -297 -303 -330 -333 -339 -342 -360 -364 -367 -372 -381 -439 -458 -462 -469 -472 -482 -493 -496 -505 -511 -537 -544 -547 -564 -567 -577 -583 -590 -605 -610 -614 -639 -643 -666 -672 -676 -679 -682 -686 -690 -694 -698 -702 -706 -710 -714 -718 -727 -732 -739 -751 -755 -758 -761 -764 -769 -775 -784 -789 -792 -812 -815 -872 -877 -896 -899 -928 -935 -982 -988 -994

>YNCQ0004W	Upstream Sequence Complementary Strand
ATAATTTTTATATTAATTGTTCTTATTTATCAGGCACCCTAGCTTGGGGGAAAAAATAAA
TTATAAATTATAAATTTCTTCCTTAACAAATATATATAATTan>ATAGAATAAACCCCTAATT
ATA>TTATATATTCAAAACCTATGGTCCGGTTTCTGGCCTTAGGGTTTTCCTCTAATATAT
TTATAan>ATAAATAGAGGGAAAAAATTATAan>ATA>TTATTAAAATAATTTTTATT>TTATTan>ATTan>A
TTATTn>AATATTAAATATTATTGTTAATA>TTATTAAATTAATTn>AATTn>AATTn>AATTn>AATTn>AA
TTn>AATTn>AATTn>AATTn>AATTan>ATTan>ATTn>TATATTTATATTTTTCTTATATTAAATATTATTn>TAT
TTAAATATATATATATATATATAATTn>TATT>TTATAAATGAAGTAATTATATTTTATATTT
ATATAAATTAATTan>ATTCATATATATATATTATTan>ATATATTATTGGATAAATATATATATT
AGAATTATATTAATATTCTTTATAan>ATATATTCATTATATATTTTTATTan>ATATTTTATTn>AA
TATTAAGTTAAATATATAATTATCAAGGCCCCGGGCCGGTGCCCTCGGCCTTGGGGCTTT
CCTCCTTATTCTATTTATATATTTAATA>TAATTan>ATTn>TATATTTAAAATTTACTTAATTan>AT
TTTAATTan>ATATATATACATATATATATATATATAATTTTTATAAATTAATAAAAATCCTT
CCTCACTATCTAGGGAAACCCCCTGGCTTGGGGATAAATTCTTCCTCACGCCCTGGGGCA
CCCTTGGCTTGGGGAAAAAATAAATTTCTTCTTCAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATA
AAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAATTAAATTAAAATTAATCCAATTA
TTTATCATTATTan>ATTTGAATTATTan>ATTan>ATTan>ATTan>ATTAAAATAAAAATATTAAATAATTan>AT
TATTan>ATTan>ATTn>AATATATATATATATAATAan>ATTan>ATTn>TATAT