Yeastract
Please fill in here our
user satisfaction survey
Thank you!
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Search by DNA motif > Result > View in Promoter Contact/Credits     Tutorial     Help

 

Back to top top

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name YNCQ0003W
Promoter Sequence

Consensus
WTAWTW: -999 -988 -983 -975 -970 -959 -954 -949 -945 -942 -937 -932 -922 -919 -914 -909 -904 -889 -883 -877 -871 -840 -820 -802 -798 -786 -762 -755 -752 -746 -743 -738 -734 -690 -673 -669 -666 -663 -654 -648 -645 -641 -631 -628 -625 -619 -604 -591 -585 -578 -559 -556 -551 -502 -489 -482 -476 -468 -413 -399 -396 -393 -390 -387 -380 -377 -374 -371 -362 -356 -351 -347 -292 -288 -279 -275 -272 -258 -249 -237 -228 -223 -218 -207 -197 -192 -183 -179 -175 -139 -134 -125 -118 -101 -93 -86 -82 -74 -71 -68 -65 -62 -51 -44 -33 -18 -11 -8 
>YNCQ0003W    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TATAATATATAAATAATA>TAATAAAATATTT>TAATATATATATAATA>TAATA>TAATTn>ATT
ATTA>TAATT>TAATATAAATTATTAan>TTA>TAATT>TAATA>TAATAAATAAATAAATAATTATA
ATTATAATTATAATTATAATCTCAATATATAAATGATAAATTATTATAAATACAAAGGAA
ATAATTGATTTTTAAAATATATTTn>AATAAAATATATAATATAAATTATACTTTTTTTGTT
ATTATATAATAan>ATTATATTAan>ATA>TATTTn>AATAGAATTAAACTCCTTCGGCCGGACTATTA
TTCATTTTATATATTAATGATAAATCATTAATTn>ATTAan>TTAan>ATAAATTTATTTATAATAan>TT
TAATTTTATATATTAan>TTAan>TTTATAATAAAAAAAATTATATTATAACAATTTAATTTTAAT
TTTTATTTTTAAATTATAAAATTAATAan>ATT>TATTTGTTTAAATAAAATTTATAACTCCTT
CGGGGTTCGGCCGGACTATTAATATAAATAAATAATAAATATTTATAATAAAATAATATA
CATCTTCTTTAAATAAAAAAAGGGGACATTATAAATAGTATATAAATATATTATATCTTT
TTTATTAan>TTAan>TTAan>TTAan>ATAAATAATAan>ATAan>ATAan>ATTTATATATTTATAATA>TATTTn>AATAG
TTCCGGGGCCCGGCCACGGGAGCCGGAACCCCGAAAGGAGAATGTATTATAATTn>ATTACA
TATAATTn>ATTAan>TTATTCACTTCTTATTAAAAATAATACTCTATATAATTTATATAATT>TA
TTT>TAATATATATATATTTATATATAATA>TAATATATATATTTn>ATTTn>ATTATAATCATTT
TTTTTTAACTTAAAATAAAACTTATTA>TAATTTATATAATTTATAATTTTTATATAAAAA
TAATTATATAATTTTTATTTn>ATTTATATAATAan>ATAan>ATAan>TTAan>TTTGTTATATATTATATAT
TATATATATAATAAATAAATAAATAATAAATAATAan>ATAAT
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
WTAWTW: -1 -4 -7 -11 -14 -18 -22 -26 -37 -44 -58 -61 -64 -67 -93 -97 -132 -142 -168 -185 -190 -211 -245 -251 -265 -268 -271 -284 -290 -349 -367 -370 -373 -376 -380 -383 -386 -389 -392 -406 -411 -444 -461 -464 -469 -478 -482 -485 -489 -495 -498 -535 -552 -555 -563 -597 -602 -612 -621 -624 -641 -656 -659 -662 -665 -683 -699 -721 -736 -739 -744 -748 -755 -772 -779 -786 -791 -800 -816 -833 -836 -863 -869 -875 -881 -885 -889 -893 -897 -902 -912 -915 -918 -925 -935 -938 -941 -947 -952 -963 -971 -976 -981 -984 -992 
>YNCQ0003W	Upstream Sequence Complementary Strand
ATATTATATATTTATTan>ATA>TTATT>TTATAAAATTATATATATATTATA>TTATATTAATAan>A
TAATATTAAATTATATTTAATAan>ATAan>ATATTAAATTATA>TTATTn>TATTn>TATTn>TATTn>AATAT
TAATATTAATATTAATATTAGAGTTATATATTTACTATTTAATAan>ATATTTATGTTTCCTT
TATTAACTAAAAATTTTATATAAATTATT>TTATATATTATATTTAATATGAAAAAAACAA
TAATATATTATTn>AATA>TAATTan>ATATAAATTATCTTAATTTGAGGAAGCCGGCCTGATAAT
AAGTAAAATATATAATTACTATTTAGTAATTAATAan>ATAan>ATTan>ATTTAAATAAATATTATAA
ATTAAAATATATAATAan>ATAAATATTATTTTTTTTAATA>TAATATTGTTAAATTAAAATTA
AAAATAAAAATTTAATATTTTAATTan>ATTAAATAAACAAATTTATTTTAAATATTGAGGAA
GCCCCAAGCCGGCCTGATAATTan>ATATTTATTn>TATTan>ATTn>TATAAATATTATT>TTATTan>ATAT
GTAGAAGAAATTTATTTTTTTCCCCTGTAATATTTATCATATATTTATA>TAATATAGAAA
AAATAATAan>ATAan>ATAan>ATTan>ATTn>TATTan>ATTan>ATTan>ATTAAATATATAAATATTATATAAATTATC
AAGGCCCCGGGCCGGTGCCCTCGGCCTTGGGGCTTTCCTCTTACATAATATTAATAATGT
ATATTAATAan>ATAan>ATAAGTGAAGAATAATTTTTATTATGAGATATATTAAATATATTAAAT
AAAATTATATATATATAAATATATATTATA>TTATATATATAAATAAATAATATTAGTAAA
AAAAAATTGAATTTTATTTTGAATAATATTAAATATATTAAATATTAAAAATATATTTTT
ATTn>AATATATTAAAAATAAATAAATATATTATTan>ATTan>ATAan>ATAAACAATATATAATATATA
ATATATATATTATTn>TATTn>TATTn>TATTan>ATTn>TATTan>ATTan>ATTA
w3c xhtml validator w3c css validator