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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name YNCI0004W
Promoter Sequence

Consensus
WTAWTW: -954 -934 -839 -836 -821 -640 -589 -555 -552 -538 -494 -431 -398 -395 -311 -162 -51
>YNCI0004W    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
ATACTGTAAGTTCTCCTCGATAGTACAGAAAACCATAACAGAACATATAATTATATGTAA
TTGTTGATAATTAGAGGTTAAAAATTAGTATTAATGAAGAAGTGAGTACTGATCTTCTTA
TACTAAATAAGAGAGGTATATAAAACACACGCCGATTGGTCATATTAan>ATTATGACCAATA
TAATA
GTGATTCCGGTAGTTACTATACATTGATGTGACGACTCATATTCCTCATATATGT
ACCTACCATAACATGTTCAACTAATAGGTCTTTAACACAGCTTCAGTATTGTCTGAGCTT
CTCGTTTAACATTCCTTCTGCAATAGGCGCAATCACACTTAAACGTATACGAGTTGTACA
TTAATATACGATGTAAGCATTAGATTGTTACCATAGCAACTCATGTCACTATTAATTACT
CTCGTTCCAACAGTAATTACCGTGGTTATTAan>ATACGGCTTGCTTATTTGTTCCCAGTTGT
CAATGAACAGTAATTGAAAGGCAGTAATAATTAGGGATAAATACTGTATATTCTTATGGT
ATATAAGAGAGAAATGGGTGAATTTTGAGATAATTGTTGGGATTCCATTGTTGATAAAGG
CTATAATAan>TTATGTATACAGTATATATACTAGAAGTTTTCCTCGAGGATTTAGGAATCCT
CAAAATGGAATCTGTATTTCTACATACTAATATTAAGATTATTCCTCATTCCGTTTTATT
CCTTATTCCGTTTTATATGTTTCATTATCCTATTACATTATCAATCCTTGCATTTCAGCT
TCCTCCAACTTCAATGACAGCTTCTCATAACTTGCGTCACCATTTAACACCGTATATGAT
AATA
TATTGATAGTGTAACTACTAGTTGATAGATGATGGTTGATTTTTACTCCAACAGGT
TTTTATTCCTACAATTTTCCGGACATATATATATAAATAAAGATCATTCATATTTACTGA
TATGGTAACATGTTTTTCTATTCAAATCAAGCTAATCAAA
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
WTAWTW: -60 -155 -304 -307 -388 -391 -490 -548 -585 -633 -828 -832 -870 -906 -946
>YNCI0004W	Upstream Sequence Complementary Strand
TATGACATTCAAGAGGAGCTATCATGTCTTTTGGTATTGTCTTGTATATTAATATACATT
AACAACTATTAATCTCCAATTTTTAATCATAATTACTTCTTCACTCATGACTAGAAGAAT
ATGATTTATTCTCTCCATATATTTTGTGTGCGGCTAACCAGTATAATTn>AATACTGGTTAT
ATTATCACTAAGGCCATCAATGATATGTAACTACACTGCTGAGTATAAGGAGTATATACA
TGGATGGTATTGTACAAGTTGATTATCCAGAAATTGTGTCGAAGTCATAACAGACTCGAA
GAGCAAATTGTAAGGAAGACGTTATCCGCGTTAGTGTGAATTTGCATATGCTCAACATGT
AATTATATGCTACATTCGTAATCTAACAATGGTATCGTTGAGTACAGTGATAATTAATGA
GAGCAAGGTTGTCATTAATGGCACCAATAATTATGCCGAACGAATAAACAAGGGTCAACA
GTTACTTGTCATTAACTTTCCGTCATTATTAATCCCTATTTATGACATATAAGAATACCA
TATATTCTCTCTTTACCCACTTAAAACTCTATTAACAACCCTAAGGTAACAACTATTTCC
GATATTATAan>ATACATATGTCATATATATGATCTTCAAAAGGAGCTCCTAAATCCTTAGGA
GTTTTACCTTAGACATAAAGATGTATGATTATAan>ATTCTAATAAGGAGTAAGGCAAAATAA
GGAATAAGGCAAAATATACAAAGTAATAGGATAATGTAATAGTTAGGAACGTAAAGTCGA
AGGAGGTTGAAGTTACTGTCGAAGAGTATTGAACGCAGTGGTAAATTGTGGCATATACTA
TTATA
TAACTATCACATTGATGATCAACTATCTACTACCAACTAAAAATGAGGTTGTCCA
AAAATAAGGATGTTAAAAGGCCTGTATATATATATTTATTTCTAGTAAGTATAAATGACT
ATACCATTGTACAAAAAGATAAGTTTAGTTCGATTAGTTT
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