S.cerevisiae - Yeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

SCEI

Promoter Sequence

Consensus
WTAWTW: -995 -979 -960 -945 -940 -929 -911 -907 -904 -901 -898 -895 -892 -889 -886 -883 -853 -829 -820 -802 -795 -784 -775 -665 -658 -649 -646 -612 -599 -549 -507 -428 -404 -300 -265 -253 -249 -245 -98 -60 -25

>SCEI    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TCAGCATATTAAGTAATCCTATTATTAGGTAATCGTTTAGATATTAATGAGATACTTATT
A>TAATATAATGATAATTCTAATCTTATAAATAATTn>ATTAan>TTAan>TTAan>TTAan>TTAan>ATAan>ATAan>ATA
>ATATGCTTTCAAGCATAGTGATAAAACATATTTATATGATAATCACTTTACTTAATAGAT
ATAATTCTTAAGTAATATATAATATATATTTTATATATATTATATATAATATAAGAGACA
ATCTCTAATTGGTAGTTTTGATGGGGCGTCATTATCAGCAAAAGTATCTGAATAAGTCCA
TAAATAAATATATAAAATTATTGAATAAAAAAAAAATAATATATATTATATATATTAan>ATT
ATAAATTGAAATATGTTTATATAAATTTATATTTATTGAATATATTTTAGTAATAGATAA
AAATATGTACAGTAAAATTGTAAGGAAAACAATAATAACTTTCTCCTCTCTCGGTGGGGG
TTCACACCTATTTTTAATAGGTGTGAACCCCTCTTCGGGGTTCCGGTTCCCTTTCGGGTC
CCGGAACTTAAATAAAAATGGAAAGAATTAAATTAATATAATGGTATAACTGTGCGATAA
TTGTAACACAAACGAGTGAAACAAGTACGTAAGTATGGCATAATGAACAAATAACACTGA
TTGTAAAGGTTATTGATAACGAATAAAAGTTACGCTAGGGATAATTTACCCCCTTGTCCC
ATTATATTGAAAAATATAATTATTCAATTAATTn>ATTTn>AATTGAAGTAAATTGGGTGAATT
GCTTAGATATCCATATAGATAAAAATAATGGACAATAAGCAGCGAAGCTTATAACAACTT
TCATATATGTATATATACGGTTATAAGAACGTTCAACGACTAGATGATGAGTGGAGTTAA
CAATAATTCATCCACGAGCGCCCAATGTCGAATAAATAAAATATTAAATAAATATCAAAG
GATATATAAAGATTTTTAATAAATCAAAAAATAAAATAAA

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
WTAWTW: -1 -6 -18 -45 -49 -53 -56 -61 -192 -245 -249 -257 -263 -346 -421 -424 -429 -445 -542 -574 -626 -638 -642 -651 -658 -661 -679 -689 -693 -768 -777 -795 -802 -876 -879 -882 -885 -888 -891 -894 -897 -900 -903 -907 -933 -938 -953 -975 -988

>SCEI	Upstream Sequence Complementary Strand
AGTCGTATAATTCATTAGGATAATAATCCATTAGCAAATCTATAATTACTCTATGAATAA
TA>TTATATTACTATTAAGATTAGAATATTTATTn>AATAan>ATAan>ATAan>ATAan>ATAan>ATTan>ATTan>ATTan>AT
TATACGAAAGTTCGTATCACTATTTTGTATAAATATACTATTAGTGAAATGAATTATCTA
TATTAAGAATTCATTATATATTATATATAAAATATATATAATATATATTATATTCTCTGT
TAGAGATTAACCATCAAAACTACCCCGCAGTAATAGTCGTTTTCATAGACTTATTCAGGT
ATTTATTn>TATATATTTTAATAACTTATTTTTTTTTTATTan>ATATATAATATATATAATTn>AA
TATTTAACTTTATACAAATATATTTAAATATAAATAACTTATATAAAATCATTATCTATT
TTTATACATGTCATTTTAACATTCCTTTTGTTATTATTGAAAGAGGAGAGAGCCACCCCC
AAGTGTGGATAAAAATTATCCACACTTGGGGAGAAGCCCCAAGGCCAAGGGAAAGCCCAG
GGCCTTGAATTTATTTTTACCTTTCTTAATT>TAATTan>ATATTACCATATTGACACGCTATT
AACATTGTGTTTGCTCACTTTGTTCATGCATTCATACCGTATTACTTGTTTATTGTGACT
AACATTTCCAATAACTATTGCTTATTTTCAATGCGATCCCTATTAAATGGGGGAACAGGG
TAATATAACTTTTTATATTAATAAGTTAATTn>AATAAATTAACTTCATTTAACCCACTTAA
CGAATCTATAGGTATATCTATTTTTATTACCTGTTATTCGTCGCTTCGAATATTGTTGAA
AGTATATACATATATATGCCAATATTCTTGCAAGTTGCTGATCTACTACTCACCTCAATT
GTTATTAAGTAGGTGCTCGCGGGTTACAGCTTATTTATT>TTATAan>ATTn>TATTn>TATAGTTTC
CTATATATTTCTAAAAATTATTTAGTTTTTTATT>TTATTT