Yeastract
Please fill in here our
user satisfaction survey
Thank you!
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Search by DNA motif > Result > View in Promoter Contact/Credits     Tutorial     Help

 

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name RDT1
Promoter Sequence

Consensus
WTAWTW: -993 -968 -919 -915 -805 -753 -749 -723 -638 -565 -544 -474 -227 -97
>RDT1    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
GATCTGTTTAATAGGTTTGCTATAAATGCACAATAATTTTTCACCCATGATACCCAATTT
CAAGAGAAGCAATTGCTACATATAATTn>ATTTAGGCTTTACTATCTACTACTCATTGACTG
TGCCCTTTTACACAATTATAACAAATATGTCAAAGCAGATGCCATGAACTTTGTATCTGA
ATTTTTGATTTCCTTTTAATTCTAATTGCAGACGACGTAAATATAGTTCTGAATTTCAAA
GTCACTGTTAATTn>AATTGTTCTAATTGTTTGGTTTTTTTAATATAAATCACTAGTGCTTA
AGTTCTGTTGACGCACACAGTACCTATCTTTGATTCCTTCGTGCAAACAGTATTCCGGCA
CGTTAATTGATACCAAAAAGATTTCAAAATCAGATGCTTCAAGACTAATTGTATACTTTA
TGTGACTTCTGGAGTTTAATTTGTTGTATTGATGAGATAATATTGTCTATTATATTGCCA
ATAACAACCAGCGCCAGGTGTACTAAGTCGAGATGACAGAAAATTTATAATAAGTGTAAA
TACAATAAATTTTGTAAATAAATAACTACTTCAATAGAAATCTCAAAGTCGAAGAAACAC
AGAACACAGAATGAAACTGGACTAAATGATTTTCAATAAAGGAAAAGCACGAAAAATTTT
TTGAACTTTTTTGGGACAGCGTGGATCGTGTAATTACTGTATTGGGAAATTTACACGATT
CTCGACAAATAAAGAAAAAGGCGCGTTTAAAGACTTACAAGCACACCTTTGAATTATTTT
TGTTCTCTATGATTATCAAATGTGCTAGTGTTTGCAAGATGGTGCTTTTTTTTCTTTAGA
TTGCCACGTTTCTGCTCCTCTTTGTGGTTTTCTTTTTTTTTTTCAATCTTACTTATAAAA
TGAATATTTCAATTGATGAATAGCTATATATTGGATACAAAAATTAGCATTTAATCGAAA
ACTGCAGCATGTATTTAATCGAAAACTACAGCATGTAGCT
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
WTAWTW: -223 -268 -435 -439 -467 -527 -537 -716 -745 -776 -852 -861 -911
>RDT1	Upstream Sequence Complementary Strand
CTAGACAAATTATCCAAACGATATTTACGTGTTATTAAAAAGTGGGTACTATGGGTTAAA
GTTCTCTTCGTTAACGATGTATATTAATAAATCCGAAATGATAGATGATGAGTAACTGAC
ACGGGAAAATGTGTTAATATTGTTTATACAGTTTCGTCTACGGTACTTGAAACATAGACT
TAAAAACTAAAGGAAAATTAAGATTAACGTCTGCTGCATTTATATCAAGACTTAAAGTTT
CAGTGACAATTAATTAACAAGATTAACAAACCAAAAAAATTATATTTAGTGATCACGAAT
TCAAGACAACTGCGTGTGTCATGGATAGAAACTAAGGAAGCACGTTTGTCATAAGGCCGT
GCAATTAACTATGGTTTTTCTAAAGTTTTAGTCTACGAAGTTCTGATTAACATATGAAAT
ACACTGAAGACCTCAAATTAAACAACATAACTACTCTATTATAACAGATAATATAACGGT
TATTGTTGGTCGCGGTCCACATGATTCAGCTCTACTGTCTTTTAAATATTATTCACATTT
ATGTTATTTAAAACATTTATTn>TATTGATGAAGTTATCTTTAGAGTTTCAGCTTCTTTGTG
TCTTGTGTCTTACTTTGACCTGATTTACTAAAAGTTATTTCCTTTTCGTGCTTTTTAAAA
AACTTGAAAAAACCCTGTCGCACCTAGCACATTAATGACATAACCCTTTAAATGTGCTAA
GAGCTGTTTATTTCTTTTTCCGCGCAAATTTCTGAATGTTCGTGTGGAAACTTAATAAAA
ACAAGAGATACTAATAGTTTACACGATCACAAACGTTCTACCACGAAAAAAAAGAAATCT
AACGGTGCAAAGACGAGGAGAAACACCAAAAGAAAAAAAAAAAGTTAGAATGAATATTTT
ACTTATAAAGTTAACTACTTATCGATATATAACCTATGTTTTTAATCGTAAATTAGCTTT
TGACGTCGTACATAAATTAGCTTTTGATGTCGTACATCGA
w3c xhtml validator w3c css validator