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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name Q0255
Promoter Sequence

Consensus
WTAWTW: -965 -953 -941 -938 -935 -926 -923 -911 -904 -898 -894 -888 -866 -861 -856 -853 -846 -841 -834 -827 -824 -803 -782 -745 -728 -669 -616 -613 -603 -599 -592 -517 -490 -461 -458 -436 -431 -426 -409 -340 -284 -260 -217 -110
>Q0255    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
AGGAGGACCGAAGGAGTTTTAGTATTTTTTTTTTTTTAATAAAATATATATTTATATGAT
TAATAan>ATAan>TTA
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TA
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GAGAAGGTGTCTTCTATGGAGCATGTTCTGAGTTGTGTGGGACAGGTCATGCAAATATGC
CAATTAAGATCGAAGCAGTATCATTACCTAAATTTTTGGA
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
WTAWTW: -33 -42 -150 -262 -280 -333 -353 -384 -424 -450 -454 -510 -515 -606 -609 -709 -721 -738 -775 -783 -795 -806 -812 -817 -820 -827 -849 -854 -859 -881 -890 -904 -907 -919 -928 -931 -934 -953 -958
>Q0255	Upstream Sequence Complementary Strand
TCCTCCTGGCTTCCTCAAAATCATAAAAAAAAAAAAATTATT>TTATATATAAATATACTA
ATTATTan>ATAan>ATATATATAATAAATATTTTTATTan>ATATATTAAAATTAATAAAAATTATTT
TTTTCCACCCCAACTATTATA>TTATA>TTATAAAAAATAAAATTAAATATTATATATTATT
>
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AATAATTACTATCACCACTTTGACAACTTAAACTTAGTATACAATAAGGACTACTTAATA
ATCTTCTTCCAGTTAATTCTAATAATCTATGACTATGAAGATATCAACATGGACATCTAT
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CTCTTCCACAGAAGATACCTCGTACAAGACTCAACACACCCTGTCCAGTACGTTTATACG
GTTAATTCTAGCTTCGTCATAGTAATGGATTTAAAAACCT
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