Yeastract
Please fill in here our
user satisfaction survey
Thank you!
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Search by DNA motif > Result > View in Promoter Contact/Credits     Tutorial     Help

 

Back to top top

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name Q0182
Promoter Sequence

Consensus
WTAWTW: -997 -971 -967 -953 -941 -929 -914 -893 -873 -870 -866 -862 -858 -854 -848 -845 -842 -839 -836 -832 -829 -826 -822 -815 -811 -808 -792 -782 -779 -746 -743 -665 -662 -657 -652 -649 -630 -625 -614 -583 -580 -563 -559 -555 -551 -547 -543 -522 -507 -498 -495 -476 -467 -464 -453 -438 -427 -402 -397 -377 -372 -364 -344 -338 -321 -312 -303 -300 -297 -294 -291 -285 -268 -264 -258 -240 -228 -212 -209 -195 -176 -167 -164 -161 -157 -149 -143 -131 -115 -112 -109 -96 -91 -88 -85 -25 -20 -17 -10 -6 
>Q0182    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TAATTAATTGATATATATATATACCAAATATAATTn>AATTGAAATTAAATAATAAATAAAA
TATTTACTTCTTTATTAAAATTCTAATTAATTGATTCTTTTTATTGAATATTAAATTCTA
TTATAACTTATTAan>ATTn>AATTn>AATTn>AATTn>AATTATAATAan>ATAan>ATAan>ATAan>TTTn>ATTAan>TTAan>ATT
ATTAAATATTTn>ATTAan>TTATATATAAGATTTAATTTTAAATATTAan>ATAAAAAAAGAATAAA
ATAAAATAAAATGAATAATAan>TTTCTTTATCTCTTTCGATCGGACTCCTTCGGCCGGACTC
CTTCGGGGTCCGCCCCGCGGGGCGGGCCGGACTATTTATTAan>TTA>TAATA>TAATAan>TTTAAT
CAATAGATTTATAATT>TATTTAATGAATATTTTATAAATATATAAAACAATTCCTTTTTA
TTAan>TTATAAATTTTTCATTATTTn>ATTTn>ATTTn>ATTTn>ATTTn>ATTTATTCAATATATAAAAAT
AATTATAAAAAGATTATTAAAAATAATAan>ATTTAATGATAAATATATATTATATATATTAan>A
TATAAAAATAATAAATATAAATATATTATGTAAATATTATATAAATTTGTATATGTATAT
ATTA>TAATAATGTTATATAAGTAATAATA>TAATAAAATATTTTATGTAATTTATATATAT
TTATAATTATAAAATAAAAATATTATAAATAATAAAATTAATAan>ATAan>ATAan>ATAan>ATTTTAAT
AAAATAAATTATATATTTn>AATTTTATTATGAAGTTTATACTTAATATAAATTATATTTCC
TTTATAAATTATTAan>ATATATCCTTTTTAATTAAATAAAATAAAAATATTATAAATATTAan>A
TAATTn>AATTTTTTATTTATATTTATATATATATTAAAGATTAAATATATTAan>TTAan>ATACTA
ATTTATAATT>TATTAan>TTAan>ATAAATAGTCCGGCCCGCCCCCTGCGGGGCGGACCCCGAAGG
AGTTCGACTTAAATTATAATT>TAATAan>ATTTTTATTTn>ATTA
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
WTAWTW: -13 -23 -78 -81 -84 -105 -108 -113 -124 -153 -157 -160 -163 -169 -172 -178 -183 -187 -202 -205 -208 -226 -233 -251 -268 -273 -278 -287 -290 -293 -296 -299 -305 -308 -314 -317 -323 -330 -360 -365 -370 -373 -390 -395 -420 -423 -431 -436 -442 -446 -449 -457 -460 -469 -476 -491 -494 -500 -514 -518 -573 -576 -599 -645 -650 -655 -658 -739 -751 -756 -772 -775 -778 -801 -804 -811 -815 -818 -822 -825 -832 -835 -838 -841 -846 -850 -854 -858 -862 -866 -876 -886 -910 -922 -937 -942 -946 -949 -953 -963 -969 -993 
>Q0182	Upstream Sequence Complementary Strand
ATTAATTAACTATATATATATATGGTTTATATTAATTAACTTTAATTn>TATTan>ATTn>TATT>TT
ATAAATGAAGAAATAATTTTAAGATTAATTAACTAAGAAAAATAACTTATAATTTAAGAT
AATATTGAATAATTn>AATTn>AATTn>AATTn>AATTn>AATA>TTATTan>ATTan>ATTan>ATAAATAATAan>ATTn>AA
TAATTn>TATAAATAATAan>ATATATATTCTAAATTAAAATTTATAan>ATTan>ATTTTTTTCTTATTT
TATT>TTATTTTACTTATTATAAAGAAATAGAGAAAGCTAGCCTGAGGAAGCCGGCCTGAG
GAAGCCCCAGGCGGGGCGCCCCGCCCGGCCTGATAAATAATAan>ATA>TTATA>TTATAAATTA
GTTATCTAAATATTAAATAAATTACTTATAAAATATTTATATATTTTGTTAAGGAAAAAT
AATAan>ATATTTAAAAAGTAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAGTTATATATTTTTA
TTn>AATATTTTTCTAATAATTTTTATTan>ATTAAATTACTATTTATATATAATATATATAATT
>ATATTTTTATTan>ATTn>TATATTTATA>TAATACATTTATAan>ATATATTTAAACATATACATATA
TAATA>TTATTACAATATATTCATTATTan>ATA>TTATT>TTATAAAATACATTAAATATATATA
AATATTAATATTTTATTTTTATAan>ATATTTATTan>ATTTTAATTan>ATTan>ATTan>ATTan>ATTAAAATTA
TT>TTATT>TAATATATAAATTAAAATAATACTTCAAATATGAATTATATTTAATATAAAGG
AAATATTTAATAan>ATTan>ATATAGGAAAAATTAATTn>TATT>TTATTTTTATAan>ATATTTATAan>ATT
>ATTn>AATTAAAAAATAAATATAAATATATATATAATTTCTAATTTATA>TAATAan>ATTATGAT
TAAATATTAAATAATAan>ATTan>ATTTATCAGGCCGGGCGGGGGACGCCCCGCCTGGGGCTTCC
TCAAGCTGAATTTAATATTAAATTATTAAAAATAAATAAT
w3c xhtml validator w3c css validator