Yeastract
Please fill in here our
user satisfaction survey
Thank you!
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Search by DNA motif > Result > View in Promoter Contact/Credits     Tutorial     Help

 

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name Q0144
Promoter Sequence

Consensus
WTAWTW: -975 -954 -919 -914 -910 -897 -894 -883 -831 -827 -824 -820 -817 -813 -810 -806 -803 -799 -796 -792 -789 -773 -767 -757 -754 -751 -747 -736 -733 -729 -725 -721 -717 -712 -699 -695 -692 -689 -686 -681 -661 -658 -655 -652 -649 -646 -637 -628 -625 -620 -615 -574 -569 -564 -561 -554 -531 -526 -510 -502 -499 -496 -487 -484 -480 -477 -407 -401 -340 -337 -334 -318 -309 -306 -230 -217 -212 -205 -168 -158 -153 -140 -126 -121 -117 -112 -108 -105 -94 -91 -88 -85 -76 -73 -70 -67 -44 -41 -38 -30 -27 -19 -16 -12 -8
>Q0144    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
ACTCCTTTTGAGATTCACACCTATTTTATTAAAAATAGGTATTCACTTAATTAAATTAAA
TTAAATTAAATTAAATTATGGATAATT>TATTTn>AATAAATATATATATTAan>ATTATAAAATA
ATA
GTCCGGCCCGCCCCGCGGGGCGGACCCCGAAAGAGTCTGCCCCTTTTTATTTn>AATAan>T
TTn>AATAan>TTTn>AATAan>TTTn>AATAan>TTTn>AATAan>TTTn>AATAan>TTT
AAAGAAGGATATATTTATAATTT
ATCATAATAan>TTAan>TTTn>AATAAGAAATTATTAan>ATTn>AATTn>AATTn>AATTn>AATT>TATTTATTGTT
TATATTTn>ATTAan>ATAan>TTAan>ATA>TAATAAAAATGTAAAATACTTAATAan>TTAan>TTAan>ATAan>TTAan>TTA
TATATAATATATATAATAan>ATA>TATTA>TATTTATATCTCCTTTATTCCTTTTTCCCCCGAT
GGGGACTTATTA>TATTA>TATTAan>TTATATATTTCTTCGATAACTTTATATATATTT>TATTT
TTATAAAAAAATATTTATATATTAan>TTAan>TTTACAATAATAan>ATTn>ATTAan>ATAGTCCGGCCCGT
CCCGCGGGGGGGAACCGAAGGAGTGCGGGACCCCGTGGGAACCGCATCCCTTTTTATTTT
TAATT
AAGAAGGAGTGAGGGACCCCGTGGGGACCGAACCCCGAAGGAGTCTTTTTTCTAT
TTATTAan>ATAan>ATAACTATAAATTATATTTAAAATAATAan>ATTTACTTGTTATAATCTTAATG
TTCCGGGGCCCGGCCACGGGAGCCGGAACCCCGAAAGGAGAAGTATATAAATATTTACTT
GTTATAATT>TATTATATATTTATAACCTCCTTCTTAAAATTATCTTTACTTTATAATAAA
AATTAATA>TAATATAATCTGATAATAATCGAATTTTATTA>TATTTn>AATT>TAATTn>AATAan>AT
A
GACAATTATTAan>TTAan>TTAan>TTTTACTTATTAan>ATAan>TTAan>ATTTAGATTTATATATATAAATAT
TATTAan>ATT
TTATATTAan>ATTTTTTATTAan>ATTn>ATTTn>ATTTTT
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
WTAWTW: -8 -12 -23 -34 -37 -40 -63 -66 -69 -81 -84 -87 -90 -101 -104 -119 -133 -146 -151 -154 -161 -177 -205 -226 -302 -305 -316 -327 -330 -333 -393 -473 -476 -480 -492 -495 -506 -554 -557 -562 -567 -613 -618 -621 -630 -639 -642 -645 -648 -651 -654 -674 -679 -682 -685 -688 -713 -717 -721 -725 -729 -732 -740 -747 -750 -785 -792 -799 -806 -813 -820 -879 -886 -890 -899 -903 -921 -926 -931 -936 -941 -946 -968
>Q0144	Upstream Sequence Complementary Strand
TGAGGAAAACTCTAAGTGTGGATAAAATAATTTTTATCCATAAGTGAATTAATT>TAATT>T
AATT>TAATT>TAATT>TAATA
CCTATTAAATAAATTATTn>TATATATATAATTn>AATATTTTAT
T
ATCAGGCCGGGCGGGGCGCCCCGCCTGGGGCTTTCTCAGACGGGGAAAAATAAATTATA
AATTATAAATTATAAATTATAAATTATAAATTATAAATTTCTTCCTATATAAATATTAAA
TAGTATTATAan>ATAAATTATTCTTTAATAan>ATTn>AATTn>AATTn>AATTn>AATTAAATAAATAACAA
ATATAAATAATTan>ATAan>ATTan>ATA>TTATTTTTACATTTTATGAATTATAan>ATAan>ATTan>ATAan>ATAan>AT
A
TATATTATATATATTATTan>ATA>TAATATAAATATAGAGGAAATAAGGAAAAAGGGGGCTA
CCCCTGAATAATA>TAATA>TAATAan>ATATATAAAGAAGCTATTGAAATATATATAAAATAAA
AATATTTTTTTATAAATATATAATAan>ATAAATGTTATTATTn>AATAan>ATTATCAGGCCGGGCA
GGGCGCCCCCCCTTGGCTTCCTCACGCCCTGGGGCACCCTTGGCGTAGGGAAAAATAAAA
ATTAATTCTTCCTCACTCCCTGGGGCACCCCTGGCTTGGGGCTTCCTCAGAAAAAAGATA
AATAATTan>ATTan>ATTGATATTTAATATAAATTTTATTan>ATTAAATGAACAATATTAGAATTAC
AAGGCCCCGGGCCGGTGCCCTCGGCCTTGGGGCTTTCCTCTTCATATATTTATAAATGAA
CAATATTAAATAATATATAAATATTGGAGGAAGAATTTTAATAGAAATGAAATATTATTT
TTAATTan>ATA>TTATATTAGACTATTATTAGCTTAAAATAATATAAATTAAATTAATTan>ATTA
TCTGTTAATAan>ATAan>ATAan>ATAAAATGAATAATTan>ATAan>ATTAAATCTAAATATATATATTTATA
>
ATAan>ATTAAAATATAATTAAAAAATAATTn>AATAAATAAAAA
w3c xhtml validator w3c css validator