S.cerevisiae - Yeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

Q0032

Promoter Sequence

Consensus
WTAWTW: -992 -976 -972 -969 -961 -958 -928 -873 -868 -826 -798 -793 -788 -782 -776 -754 -751 -747 -741 -738 -734 -728 -725 -720 -714 -646 -642 -637 -634 -628 -625 -576 -565 -560 -555 -552 -549 -545 -532 -527 -524 -519 -516 -513 -509 -502 -494 -489 -485 -474 -470 -465 -462 -459 -456 -453 -450 -447 -444 -435 -432 -400 -397 -357 -350 -346 -342 -335 -332 -319 -316 -298 -272 -268 -265 -259 -254 -250 -239 -236 -233 -203 -199 -196 -184 -179 -176 -172 -169 -166 -101 -94 -91 -88 -85 -78 -75 -69 -62 -59 -56 -53 -46 -37 -34 -24 -21 -18 -7

>Q0032    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
ATTATATCTTATTAATGATAAATTATAATTn>ATTAan>TTAAAATAATAan>ATTTACTTCTTTTGA
TATAAAAATAAAATAATATAGTTCCGGGGCCCGGCCACGGGAGCCGGAACCCCGGAAGGA
GATAAATATATTA>TATTTTTATTCCTACCTATTAAAGGTAAAGACTCGATTCTCATAATT
AAATTTATATCCTTCGGCCGGATTAATT>TATTT>TATTTATATTTATATTTATAGTGAATA
CCTTTTTTAATAan>TTTn>ATTTTTAATAan>TTTn>ATTTTTAATAan>TTT>TATTTTTAATAAAATATAA
TCTTGTAAGTAAGAAAAGAATTTCGGTGATTGGAACCTTGAAAGGATAAATTTCTTATTT
ATTA>TAATAan>TTTATATTAan>ATAGTTCCGGGGCCCGGCCACGGGAGCCGGAACCCCGAAAGG
AGTATTATTAAACATTTAATA>TATTA>TATTAan>ATAan>TTTn>AATTTAAATGATTAATA>TATTAan>T
TA>TAATAan>ATAan>TTTn>ATTTTATATTAAAATATTA>TAATTn>AATATATATATATTTn>ATTT>TAAT
AATAan>TTAan>TTAan>TTAan>TTAan>TTAan>TTAAAATTATTAan>TTTTTATAAATATATATATATATATATAT
ATATTAan>TTTTTATTCTTATATAAATTATATAAAAAAAATATATATAATATATAATTn>AATT
AATATATATTAan>TTTAAATTATATATTAan>TTTAAAATACTTTTTATATTATATCTTCTTTAA
ATTAAAATATAATTn>ATTAan>TTTATATTA>TAATTn>ATTTATGAAATATTAan>TTAan>TTAAAATAAA
AAAGAGGTTTAGACTATATATTTn>ATTAan>TTTATAAACTTATTA>TATTAan>TTTn>ATTAan>TTAan>ATA
GTTCCGGGGCCCGGCCACGGGAGCCGGAACCCCGAAAGGAGAAATAAATAAAATAAAAAA
TAATAAATATTAan>ATAan>TTAan>TTAAATATTAan>TTTATAATAAATATTAan>ATAan>TTAan>TTAAATATTA
TTCATATTAan>ATAAATTTTATTAan>TTAan>TTTGTAATATATTAA

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
WTAWTW: 0 -5 -14 -17 -27 -30 -39 -42 -46 -49 -52 -55 -58 -62 -71 -74 -78 -81 -84 -87 -90 -94 -97 -104 -109 -113 -162 -165 -172 -177 -192 -221 -226 -229 -232 -235 -246 -252 -261 -264 -270 -275 -291 -312 -319 -328 -335 -338 -342 -350 -359 -372 -393 -416 -428 -431 -437 -440 -443 -446 -449 -452 -455 -458 -478 -481 -487 -490 -495 -509 -512 -517 -520 -525 -545 -548 -553 -558 -569 -572 -621 -630 -635 -702 -707 -721 -734 -747 -818 -845 -866 -871 -921 -924 -929 -954 -957 -962 -965 -968 -974 -985

>Q0032	Upstream Sequence Complementary Strand
TAATATAGAATAATTACTATTTAATATTAATAan>ATAan>ATT>TTATTan>ATTAAATGAAGAAAACT
ATATTTTTATT>TTATTan>ATATCAAGGCCCCGGGCCGGTGCCCTCGGCCTTGGGGCCTTCCT
CTATTTATA>TAATATAAAAATAAGGATGGATAATTTCCATTTCTGAGCTAAGAGTATTAA
TTTAAATATAGGAAGCCGGCCTAATTAAATAAAATAAATATAAATATAAATATCACTTAT
GGAAAAAATTATAAATAAAAATTATAAATAAAAATTATAAAATAAAAATTATT>TTATATT
AGAACATTCATTCTTTTCTTAAAGCCACTAACCTTGGAACTTTCCTATTTAAAGAATAAA
TAATA>TTATAAATATAATTATCAAGGCCCCGGGCCGGTGCCCTCGGCCTTGGGGCTTTCC
TCATAATAan>ATTTGTAAATTATA>TAATA>TAATTan>ATAAATTAAATTTACTAATTATA>TAATA
>ATA>TTATTan>ATAAATAAAATATAATT>TTATAan>ATATTAATTan>ATATATATATAAATAAAATTA
TTATAan>ATAan>ATAan>ATAan>ATAan>ATAan>ATTTTAATAan>ATAAAAATATTTATATATATATATATATATA
TATAATAAAAATAAGAATATATTTAATATATTTTTTTTATATATATTATATATTAATTn>AA
TTATATATAATAAATTTAATATATAATAAATTTTATGAAAAATATAATATAGAAGAAATT
TAATT>TTATATTAATAan>ATAAATATAATATTAATAAATACTTTATAan>ATAan>ATAan>ATT>TTATTT
TTTCTCCAAATCTGATATATAAATAATAAATATTTGAATAATA>TAATAAATAATAan>ATTAT
CAAGGCCCCGGGCCGGTGCCCTCGGCCTTGGGGCTTTCCTCTTTATTn>TATT>TTATTTTTT
ATTan>ATTn>TATAan>ATTan>ATAan>ATAan>ATTn>TATAan>ATAAATATTATTn>TATAan>ATTan>ATAan>ATAan>ATTn>TATAan>AT
AAGTATAATTan>ATTTAAAATAATAan>ATAAACATTATA>TAATT