Yeastract
Please fill in here our
user satisfaction survey
Thank you!
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Search by DNA motif > Result > View in Promoter Contact/Credits     Tutorial     Help

 

Back to top top

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name Q0017
Promoter Sequence

Consensus
WTAWTW: -997 -984 -980 -977 -974 -970 -965 -956 -920 -878 -874 -871 -868 -865 -862 -859 -855 -842 -835 -832 -829 -820 -817 -791 -788 -785 -779 -776 -773 -755 -710 -707 -704 -700 -694 -690 -681 -678 -675 -671 -665 -661 -652 -646 -642 -589 -586 -577 -574 -570 -542 -539 -530 -520 -517 -514 -507 -503 -498 -490 -485 -480 -475 -470 -467 -463 -441 -432 -429 -417 -409 -395 -387 -384 -381 -363 -350 -327 -300 -295 -290 -280 -275 -272 -269 -265 -262 -257 -226 -223 -214 -211 -207 -171 -168 -163 -154 -151 -148 -142 -135 -129 -122 -118 -67 -62 -55 -50 -37 -32 
>Q0017    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
AAAATATTATAATCATATATTTn>AATAan>TTAan>TTTn>AATA>TATTTTATATATTATATCTTTTAT
TGATTTATATATATATAGATTTAATAAATATATATATATATATATATATAAATATTCATT
ATATATTTn>ATTAan>TTAan>TTAan>TTAan>TTAan>TTTn>ATTACTATTTTTTATTATATATTAan>ATAan>ATATAT
ATATTAan>TTAGTTATGGGTATCCTAATAGTATATTAan>TTAan>TTTTTAATAan>ATAan>ATTTATGATT
TATGTATAATAAATAAGTAGGGAATCGGTACGAATATCGAAAGGAGTTATATATTAan>TTAan>A
TTn>ATTTATAATTn>ATTTTATATATTAan>TTAan>ATTn>ATTTATAATTn>ATTTTATATATTTATAATT
ATTTTATATAGATAGGTTAGATAGGATAGATAGTATAGATAGGGGTCCCATTTATTAan>TTT
ACAATAATAan>ATTn>ATTAATGGGACCCGGATATCTTATTGTTATTAan>ATTTATATATTATTCA
TTATTAan>TTAan>ATATATATTTn>AATA>TAATTAAATATTA>TATTA>TATTA>TATTA>TATTAan>TTTn>A
TTAAAAAAAAATCTATTACTTATTTTTTTTATTAan>ATATATAAATTATTTATATAATTTAT
CATTTTTATTTATATATTAan>TTAan>TTTTTTATATATAAATTAATATATATATATATTATATA
TACTTTTTTTTTTATAATATATCTATATATATAAATAAATATATTA>TATTA>TATTTTTAT
ATAATA>TATTAan>TTAan>ATTn>ATTAan>TTT>TAATTTTCTATTCTATTGTGGGGGTCCCAATTATTA
>TTTTCAATAATAan>ATTn>ATTATTGGGACCCGGATATCTTCTTGTTTATCATTTATTAan>TTT>TA
TTAAATTTATTAan>TTAan>TTTTTAATTTATATTTATATTATATAATTn>AATTATATCGTTTATA
CTCCTTCGGGGTCCCCGCCGGGGCGGGGACTTTATATTT>TATTATATAATA>TATTATATT
CTTATAATA>TATTTATTGATTATGTTATAAAATTTATTCT
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
WTAWTW: -30 -43 -48 -55 -110 -114 -122 -144 -147 -156 -164 -200 -203 -207 -219 -222 -258 -261 -265 -268 -273 -288 -293 -298 -302 -320 -343 -356 -359 -377 -380 -413 -422 -425 -456 -463 -468 -473 -478 -483 -486 -490 -496 -507 -510 -513 -523 -535 -563 -566 -570 -582 -638 -657 -667 -671 -674 -686 -696 -700 -703 -744 -748 -769 -772 -781 -784 -813 -822 -825 -828 -835 -855 -858 -861 -864 -867 -885 -909 -913 -949 -963 -970 -973 -990 -993 
>Q0017	Upstream Sequence Complementary Strand
TTTTATAan>ATATTAGTATATAAATTATAan>ATAAATTATATAAAATATATAATATAGAAAATA
ACTAAATATATATATATCTAAATTATTn>TATATATATATATATATATATATTTATAAGTAA
TATATAAATAATAan>ATAan>ATAan>ATAan>ATAAATAATGATAAAAAATAATATATAATTan>ATTan>ATATA
TATAATAATCAATACCCATAGGATTATCATATAATAan>ATAAAAATTATTan>ATTAAATACTAA
ATACATATTATTn>TATTCATCCCTTAGCCATGCTTATAGCTTTCCTCAATATATAATAan>ATT
AATAAATATTAATAAAATATATAATAan>ATTn>AATAAATATTAATAAAATATATAAATATTAA
TAAAATATATCTATCCAATCTATCCTATCTATCATATCTATCCCCAGGGTAAATAATAAA
TGTTATTATTn>AATAan>ATTACCCTGGGCCTATAGAATAACAATAATTAAATATATAATAAGT
AATAATAan>ATTan>ATATATAAATTATATTAATTn>TATAan>ATA>TAATA>TAATA>TAATA>TAATAAAT
AATTTTTTTTTAGATAATGAATAAAAAAAATAATTan>ATATATTTAATAAATATATTAAATA
GTAAAAATAAATATATAATAan>ATAAAAAATATATATTTAATTan>ATATATATATATAATATAT
ATGAAAAAAAAAATATTATATAGATATATATATTTATTn>TATA>TAATA>TAATATAAAAATA
TATTATA>TAATAan>ATTn>AATAan>ATAAAATTAAAAGATAAGATAACACCCCCAGGGTTAATAan>AT
AAAAGTTATTATTn>AATAan>ATAACCCTGGGCCTATAGAAGAACAAATAGTAAATAATAAAAT
AATTTAAATAATAan>ATAAAAATTAAATATAAATATAATATATTAATTn>AATATAGCAAATAT
GAGGAAGCCCCAGGGGCGGCCCCGCCCCTGAAATATAAAATAATATATTATA>TAATATAA
GAATATTATATAAATAACTAATACAATATTTTAAATAAGA
w3c xhtml validator w3c css validator