Yeastract
Please fill in here our
user satisfaction survey
Thank you!
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Search by DNA motif > Result > View in Promoter Contact/Credits     Tutorial     Help

 

Back to top top

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name Q0017
Promoter Sequence

Consensus
ATATA: -986 -967 -958 -934 -932 -930 -928 -913 -911 -909 -907 -905 -903 -901 -899 -897 -895 -880 -837 -826 -824 -822 -712 -683 -654 -635 -532 -511 -509 -500 -426 -424 -411 -389 -372 -370 -360 -358 -356 -354 -352 -345 -343 -324 -316 -314 -312 -302 -282 -277 -124 -57 -52 -34 
>Q0017    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
AAAATATTATAATCATATATTTAATATTATTTAATATATTTTATATATTATATCTTTTAT
TGATTTATATAan>TAan>TAan>TAGATTTAATAAATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAAATATTCATT
ATATATTTATTATTATTATTATTATTTATTACTATTTTTTATTATATATTAATAATATAan>T
ATATTATTAGTTATGGGTATCCTAATAGTATATTATTATTTTTAATAATAATTTATGATT
TATGTATAATAAATAAGTAGGGAATCGGTACGAATATCGAAAGGAGTTATATATTATTAA
TTATTTATAATTATTTTATATATTATTAATTATTTATAATTATTTTATATATTTATAATT
ATTTTATATAGATAGGTTAGATAGGATAGATAGTATAGATAGGGGTCCCATTTATTATTT
ACAATAATAATTATTAATGGGACCCGGATATCTTATTGTTATTAATTTATATATTATTCA
TTATTATTAATATAan>TATTTAATATAATTAAATATTATATTATATTATATTATATTATTTA
TTAAAAAAAAATCTATTACTTATTTTTTTTATTAATATAan>TAAATTATTTATATAATTTAT
CATTTTTATTTATATATTATTATTTTTTATATAan>TAAATTAATATAan>TAan>TAan>TAan>TATTATATA
>TACTTTTTTTTTTATAATATATCTATATAan>TAan>TAAATAAATATATTATATTATATTTTTAT
ATAATATATTATTAATTATTATTTTAATTTTCTATTCTATTGTGGGGGTCCCAATTATTA
TTTTCAATAATAATTATTATTGGGACCCGGATATCTTCTTGTTTATCATTTATTATTTTA
TTAAATTTATTATTATTTTTAATTTATATTTATATTATATAATTAATTATATCGTTTATA
CTCCTTCGGGGTCCCCGCCGGGGCGGGGACTTTATATTTTATTATATAATATATTATATT
CTTATAATATATTTATTGATTATGTTATAAAATTTATTCT
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
ATATA: -28 -41 -46 -53 -63 -108 -120 -125 -131 -271 -278 -286 -291 -296 -308 -310 -312 -318 -339 -341 -346 -348 -350 -352 -354 -366 -368 -383 -385 -407 -420 -466 -471 -476 -481 -503 -505 -526 -528 -631 -648 -650 -677 -679 -706 -708 -787 -816 -818 -820 -831 -833 -874 -876 -891 -893 -895 -897 -899 -901 -903 -905 -907 -924 -926 -928 -930 -947 -952 -954 -961 -980 
>Q0017	Upstream Sequence Complementary Strand
TTTTATAATATTAGTATATAAATTATAATAAATTATATAAAATATAan>TAATATAGAAAATA
ACTAAATATAan>TAan>TAan>TATCTAAATTATTTATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TATTTATAAGTAA
TATAan>TAAATAATAATAATAATAATAAATAATGATAAAAAATAATATAan>TAATTATTATATA
>TATAATAATCAATACCCATAGGATTATCATATAATAATAAAAATTATTATTAAATACTAA
ATACATATTATTTATTCATCCCTTAGCCATGCTTATAGCTTTCCTCAATATAan>TAATAATT
AATAAATATTAATAAAATATAan>TAATAATTAATAAATATTAATAAAATATAan>TAAATATTAA
TAAAATATATCTATCCAATCTATCCTATCTATCATATCTATCCCCAGGGTAAATAATAAA
TGTTATTATTAATAATTACCCTGGGCCTATAGAATAACAATAATTAAATATAan>TAATAAGT
AATAATAATTATATAan>TAAATTATATTAATTTATAATATAATATAATATAATATAATAAAT
AATTTTTTTTTAGATAATGAATAAAAAAAATAATTATATATTTAATAAATATATTAAATA
GTAAAAATAAATATAan>TAATAATAAAAAATATAan>TATTTAATTATATAan>TAan>TAan>TAan>TAATATAan>T
ATGAAAAAAAAAATATTATATAGATATAan>TAan>TATTTATTTATATAATATAATATAAAAATA
TATTATATAATAATTAATAATAAAATTAAAAGATAAGATAACACCCCCAGGGTTAATAAT
AAAAGTTATTATTAATAATAACCCTGGGCCTATAGAAGAACAAATAGTAAATAATAAAAT
AATTTAAATAATAATAAAAATTAAATATAAATATAATATATTAATTAATATAGCAAATAT
GAGGAAGCCCCAGGGGCGGCCCCGCCCCTGAAATATAAAATAATATATTATATAATATAA
GAATATTATATAAATAACTAATACAATATTTTAAATAAGA
w3c xhtml validator w3c css validator