Yeastract
Please fill in here our
user satisfaction survey
Thank you!
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Search by DNA motif > Result > View in Promoter Contact/Credits     Tutorial     Help

 

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name OLI1
Promoter Sequence

Consensus
WTAWTW: -988 -980 -973 -969 -949 -940 -898 -878 -857 -853 -850 -844 -841 -838 -819 -814 -809 -805 -801 -797 -793 -789 -783 -780 -777 -774 -767 -757 -754 -739 -732 -723 -687 -676 -664 -661 -658 -655 -627 -623 -612 -607 -604 -601 -558 -555 -552 -524 -502 -499 -496 -491 -485 -482 -479 -465 -461 -365 -340 -337 -333 -330 -323 -320 -315 -311 -308 -305 -302 -299 -296 -291 -282 -276 -273 -270 -262 -259 -248 -243 -240 -237 -234 -202 -182 -174 -171 -166 -163 -158 -135 -122 -119 -111 -101 -96 -86 -64 -61 -46 -20 -16
>OLI1    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
AATAAAATAAACTTAATTAAATATTATATATTTn>ATTTACAATTATATATATATATTACTC
ATAATTAAATTAAATTAAGATGCAATTCAATACGGTTGTATTATATTATTCATCAAATAT
TGTTAATATTGATACCTACAGAGATATTTn>AATAan>TTTTTATTAan>TTAan>TTATCCATTACTTTT
TTTATTA>TATTT>TAATTn>ATTTn>ATTTn>ATTTn>ATTTn>ATTTATAATAan>ATAan>ATAan>TTTCATATTAT
CAATTATTAan>TTTTTTTTTTTTATAATATATAATTAAATTATTTATATAGTTCCCCGAAAG
GAGAATAAATAAAATATTATATAAATATTTATATCTTTATTAan>ATAan>TTAan>ATATAAGTAATA
TATATAGTTTATGATATTTn>AATTTTATCATAATA>TAATAan>ATAan>ATTATATAAATCTTATAC
ACATTTATATAAGTATATATATATATTAan>TTAan>ATATAATGAACATCTATTAAATAAAATAA
TT
GTAAATCTCAAGTAAATTATTAan>TTAan>TTT>TATTTTTAATAan>ATAan>ATTTATGATTTATAAT
TAATA
AATAAAAGAGTAATTATATGATAAAAAAGGTAATAAATAAAATTTATAGTTCCGG
GGCCCGGCCACGGGAGCCGGAACCCCGAAAGGAGTTTATTTATATATATATATATATGAA
TTAATAan>TTTn>AATAan>ATAAATAATAan>ATA>TAATTn>AATAan>ATAan>TTAan>TTAan>TTAan>TTA>TAATTTTTTT
ATTT
ATAATAan>TTAan>ATAAAATATTAan>TTATATATATATTA>TAATAan>ATAan>TTAan>ATAAGATATAT
AAATAAGTCCCTTTTTTTTTATTTAAAATAAAGAAAGAATAATTAAATAATAan>TTT>TAATA
>
ATT>TAATTAAATAGTGTATTAAAAGATAATAAAAAGTAATATTAan>ATATGTTAATTATATA
TAATA>TATTT
ATATATAATTATATATATATATATAAATAATAan>ATAAATATATATATAATA
TAAAAATAAGAATAGATTAAATATTTn>AATAAATAAATATT
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
WTAWTW: -1 -5 -9 -16 -31 -39 -50 -54 -57 -60 -78 -94 -103 -112 -115 -118 -128 -138 -150 -159 -167 -170 -174 -189 -214 -227 -230 -233 -236 -241 -252 -255 -258 -263 -266 -269 -289 -292 -295 -298 -301 -304 -307 -313 -316 -319 -323 -326 -333 -336 -415 -419 -438 -450 -454 -457 -475 -478 -492 -495 -498 -520 -525 -529 -545 -548 -551 -593 -597 -600 -605 -639 -648 -651 -654 -657 -672 -680 -683 -688 -719 -724 -732 -750 -753 -760 -770 -773 -776 -801 -812 -831 -834 -837 -846 -871 -880 -891 -896 -922 -927 -932 -955 -973 -976 -980 -990
>OLI1	Upstream Sequence Complementary Strand
TTATTTTATTTGAATTAATTn>TATAan>ATATATAAATAAATGTTAATATATATATATAATGAG
TATTAATT>TAATT>TAATTCTACGTTAAGTTATGCCAACATAATA>TAATAAGTAGTTTATA
ACAATTATAACTATGGATGTCTCTATAAATTATAAAAATAATAan>ATAan>ATAGGTAATGAAAA
AAATAATATAAAATTAATAAATAAATAAATAAATAAATATTATTan>ATTan>ATAAAGTATAATA
GTTAATAan>ATAAAAAAAAAAAATATTATATATTAATT>TAATAAATATATCAAGGGGCTTTC
CTCTTATTTATT>TTATAan>ATATATTTATAAATATAGAAATAATTan>ATAan>ATTan>ATATTCATTAT
A
TATATCAAATACTATAAATTAAAATAGTATTATA>TTATTan>ATTn>AATATATTTAGAATATG
TGTAAATATATTCATATATATATATAATAan>ATTan>ATATTACTTGTAGATAATTn>TATT>TTATT
AACATTTAGAGTTCATTTAATAan>ATAan>ATAAAATAAAAATTATTan>ATTAAATACTAAATATTA
ATTan>ATTn>TATT
TTCTCATTAATATACTATTTTTTCCATTATTn>TATTTTAAATATCAAGGCC
CCGGGCCGGTGCCCTCGGCCTTGGGGCTTTCCTCAAATAAATATATATATATATATACTT
AATTan>ATA
AATTATTan>ATTn>TATTan>ATTan>ATATTAATTan>ATTan>ATAan>ATAan>ATAan>ATAan>ATATTAAAAAAA
TAAATATTATAan>ATTan>ATT>TTATAan>ATAan>ATATATATATAATA>TTATTan>ATAan>ATTan>ATTCTATATA
TTTATTCAGGGAAAAAAAAATAAATTTTATTTCTTTCTTATTAATTn>TATTan>ATAAAATTAT
T
AAATTAATTTATCACATAATTTTCTATTATTTTTCATTATAan>ATTan>ATACAATTAATATAT
ATTATATAAATATATATTAATATATATATATATATTTATTan>ATTan>ATTn>TATATATATATTAT
A
TTTTTATTCTTATCTAATTTATAAATTATTn>TATTn>TATAA
w3c xhtml validator w3c css validator