S.cerevisiae - Yeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

CSS3

Promoter Sequence

Consensus
WTAWTW: -994 -991 -861 -847 -652 -567 -552 -395 -269 -258

>CSS3    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
GCTCATTTAATAan>TTAGGTATTTTGCCCATGTCATTTTTGTGCAAGTCATTTTCTCCTTTG
GAACTAAATTTTCTTTAAAATATCTCATATACAAAAAATCCTAACTCACAAGTTAATGTT
TTCCATCATAAGTAGACGTTTATTTAAAACATGTTATTATATATTGATCCACTCTTTGCA
GTGTCGTTTTCCTACAAAAATTAGATACTTAATCTTGAGGAGTGTAGAAATAAGTGAAGG
CGACATAAAGATAGAGAAACAGCCATGAAATTTAGTGAAAGCTGACACTCAAGAATTAGG
AATGTAATAAGATAATGAATCACAACATATAAAATGGAAAGTGAAGTAATAATACTATTC
TATAGAATAATCGACGATCCTTCATGAATTGCTATATATCTGAGGAGAACTTCTAGCATA
TCCTGCATACCTAATATTATAGCCTTCAATAATAATGAAAATCCTAACAATTATCCAATT
ATTCACCAAATTCTCTATTTCAACAGTAGTATTATGGCATTGATTATATTGCAAGCTATA
GATTCGATTTCATGAATTCATAACACTCTAAAAGAGAACTTCTGCAATACTCTGTACAAA
TAACATTATTACTTTTACTAAAAATAGATTTCCGGACACTAACTTTTGAATTCTTATCAA
AGCAGTCGAATGCCGCGTCCTACGGTTTATGTATATAGATTTAAAAATACACGTTAAAGA
CTGTTTTCTCCATAATTCTTGTTTAATATACCTATGAACATAAGCGAGTCAATCAAACTC
GGGAGTAAAATGCTTTAAGGCACGCCGCTTAACCTTTTAAAATACATGTCTGAACATTAT
GTAACCAAACTAAAATTGCTTTTAAATGGATCCGCGCAATATCTAAAAACATTAACTATA
AAGGATAAAAATTTTGGACAAAAAATAGCAGTAGCATGTTTGCTTCCTAAGCGTTTGAAG
TCAAAACCATTTTTAAAAGGGTAGAGAGGCTTAGTAAAAA

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
WTAWTW: -251 -397 -485 -518 -526 -545 -560 -563 -648 -690 -767 -840 -917 -987

>CSS3	Upstream Sequence Complementary Strand
CGAGTAAATTATAATCCATAAAACGGGTACAGTAAAAACACGTTCAGTAAAAGAGGAAAC
CTTGATTTAAAAGAAATTTTATAGAGTATATGTTTTTTAGGATTGAGTGTTCAATTACAA
AAGGTAGTATTCATCTGCAAATAAATTTTGTACAATAATATATAACTAGGTGAGAAACGT
CACAGCAAAAGGATGTTTTTAATCTATGAATTAGAACTCCTCACATCTTTATTCACTTCC
GCTGTATTTCTATCTCTTTGTCGGTACTTTAAATCACTTTCGACTGTGAGTTCTTAATCC
TTACATTATTCTATTACTTAGTGTTGTATATTTTACCTTTCACTTCATTATTATGATAAG
ATATCTTATTAGCTGCTAGGAAGTACTTAACGATATATAGACTCCTCTTGAAGATCGTAT
AGGACGTATGGATTATAan>ATATCGGAAGTTATTATTACTTTTAGGATTGTTAATAGGTTAA
TAAGTGGTTTAAGAGATAAAGTTGTCATCATAATACCGTAACTAATATAACGTTCGATAT
CTAAGCTAAAGTACTTAAGTATTGTGAGATTTTCTCTTGAAGACGTTATGAGACATGTTT
ATTGTAATAATGAAAATGATTTTTATCTAAAGGCCTGTGATTGAAAACTTAAGAATAGTT
TCGTCAGCTTACGGCGCAGGATGCCAAATACATATATCTAAATTTTTATGTGCAATTTCT
GACAAAAGAGGTATTAAGAACAAATTATATGGATACTTGTATTCGCTCAGTTAGTTTGAG
CCCTCATTTTACGAAATTCCGTGCGGCGAATTGGAAAATTTTATGTACAGACTTGTAATA
CATTGGTTTGATTTTAACGAAAATTTACCTAGGCGCGTTATAGATTTTTGTAATTGATAT
TTCCTATTTTTAAAACCTGTTTTTTATCGTCATCGTACAAACGAAGGATTCGCAAACTTC
AGTTTTGGTAAAAATTTTCCCATCTCTCCGAATCATTTTT