S.cerevisiae - Yeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

COX3

Promoter Sequence

Consensus
WTAWTW: -997 -982 -977 -968 -961 -952 -943 -940 -924 -870 -861 -849 -845 -842 -833 -820 -804 -790 -787 -774 -769 -742 -739 -733 -730 -726 -691 -669 -617 -598 -595 -581 -576 -573 -570 -566 -562 -540 -537 -534 -530 -512 -506 -503 -481 -465 -462 -459 -446 -430 -425 -420 -411 -402 -399 -396 -388 -385 -382 -379 -376 -373 -370 -367 -359 -330 -326 -320 -317 -314 -311 -281 -278 -267 -264 -260 -256 -250 -246 -228 -197 -190 -178 -173 -170 -161 -157 -152 -145 -142 -139 -123 -115 -112 -109 -106 -102 -96 -77 -74 -69 -66 -63 -54 -50 -46 -42 -36 -25

>COX3    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
AAATTATTAAATAAATATATAATA>TATTATATATAATTTATAATATATATATTATAAATA
TTAan>TTATATATAAAATATAATATACTACTTATAAAAATATATATATATATATAAATATAT
ATATAAATAAATATTTTATATATTAAATTAAATAATTn>ATTAan>ATAAATTTAATTATAAAGT
ATAATTTTCAATAGGAATATTTATAAGATTATAATAan>ATTATATGAATTATTA>TAATTATA
TATATATAAATAAATAAAATAATAan>ATTATAATAan>ATTn>AATAAGAGTTTTGGATATATATCT
GTGGAGTATATATTTTATAAAGGAGATTAGCTTAATTGGTATAGCATTCGTTTTACACAC
GAAAGATTATAGGTTCGAACCCTATATTTCCTAAATCTAGATATAATAan>TTATATCTATCT
TAATA>TAATAan>ATAan>TTTn>ATTTn>ATTAAATAAAAAAAAAATAAATAATAan>TTAan>ATTn>AATATAAG
ATTCTTTTTTAATTATAATAan>ATAAATAAATAAAAAGAAGATATTATCAATGATTTATATT
AATAan>ATAAATATAAATAATAAAAAATATATATAATA>TAATA>TAATAAATATATTTCCTTT
AATAan>TTAan>ATAAATTAATAan>ATAan>ATAan>ATAan>ATAan>ATAan>ATAan>ATAAAATATTTAAATAAATTATAT
TCAATACAAATTAATTn>ATTTATATTAan>TTAan>ATAan>ATTGAATAAATAATCCGGTCGAAAGAGA
TATTAan>ATTCGATTATATTAan>TTTn>ATTTn>AATTATATTTn>AATTTAAATATATAAATTAATATA
TATATATTGAATTATATATAAATTTATTTTATAATTTTATAAATAATA>TATTAan>TTATAAA
TATTTn>AATA>TAATTTATATTAan>TTAan>TTAAATAAAAGATTTATTAAATTAATAan>TTAan>TTAan>TTT
AATTTTATTATATAGTTTAAGGGATAATAan>TTT>TATTAan>ATAan>TTTTTTTTATTTn>ATTTn>ATTT
AATTATATTATATATATAATATATATATAACAATAAATTT

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
WTAWTW: -18 -29 -34 -59 -62 -70 -89 -102 -105 -108 -111 -116 -128 -132 -135 -138 -150 -157 -163 -166 -171 -174 -205 -221 -224 -233 -248 -260 -274 -295 -307 -310 -313 -322 -326 -342 -347 -355 -360 -363 -366 -369 -372 -375 -378 -381 -384 -389 -392 -395 -409 -413 -418 -423 -432 -439 -442 -448 -452 -455 -458 -474 -488 -492 -496 -499 -504 -523 -526 -530 -533 -536 -540 -551 -555 -566 -569 -574 -588 -591 -719 -722 -726 -731 -735 -738 -743 -747 -761 -767 -770 -779 -783 -825 -835 -838 -841 -845 -849 -854 -866 -870 -882 -900 -917 -922 -933 -936 -939 -945 -954 -970 -975 -982 -986 -990 -993

>COX3	Upstream Sequence Complementary Strand
TTTAATAan>ATTn>TATTn>TATATATTATA>TAATATATATTAAATATTATATATATAATATTTAT
AATAan>ATATATATTTTATA>TTATATGATGAATATTTTTATATATATATATATATTTATATA
TATATTTATTn>TATAAAATATATAATT>TAATTn>TATTn>AATAan>ATTan>ATTTAAATTAATATTTCA
TATTAAAAGTTATCCTTATAAATATTCTAATATTATTn>AATATACTTAATAan>ATATTAATAT
ATATATATTTATTn>TATT>TTATTan>ATTn>AATA>TTATTn>AATTan>ATTCTCAAAACCTATATATAGA
CACCTCATATATAAAATATTTCCTCTAATCGAATTAACCATATCGTAAGCAAAATGTGTG
CTTTCTAATATCCAAGCTTGGGATATAAAGGATTTAGATCTATATTATAan>ATATAGATAGA
ATTATA>TTATTan>ATAAATAAATAATTn>TATTTTTTTTTTATTn>TATTan>ATAan>ATTn>AATTan>ATATTC
TAAGAAAAAATTAATA>TTATTan>ATTn>TATTn>TATTTTTCTTCTATAATAGTTACTAAATATAA
TTATTan>ATTn>TATATTTATTan>ATTTTTTATATATATTATA>TTATA>TTATTn>TATATAAAGGAAA
TTATAan>ATTan>ATT>TAATTan>ATTan>ATTan>ATTan>ATTan>ATTan>ATTan>ATTan>ATT>TTATAAATTTATT>TAATATA
AGTTATGTTTAATTn>AATAAATATAATAan>ATTan>ATTAACTTATTTATTAGGCCAGCTTTCTCT
ATAATTAAGCTAATATAATAAATAAATTAATATAAATTAAATTTATATATTTAATTan>ATAT
ATATATAACTTAATATATATTTAAATAAAATATTAAAATATTTATTan>ATA>TAATAan>ATATTT
ATAAATTATATTAAATATAATAan>ATAan>ATTn>TATTTTCTAAATAATT>TAATTan>ATAan>ATAan>ATAAA
TTAAAATAATATATCAAATTCCCTATTATAAAATAATTan>ATAAAAAAAATAAATAAATAAA
TTAATA>TAATATATATATTATATATATATTGTTATTTAAA