Yeastract
Please fill in here our
user satisfaction survey
Thank you!
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Search by DNA motif > Result > View in Promoter Contact/Credits     Tutorial     Help

 

Back to top top

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name AI3
Promoter Sequence

Consensus
WTAWTW: -996 -992 -961 -930 -927 -912 -902 -895 -892 -880 -876 -864 -861 -858 -855 -852 -842 -839 -835 -817 -814 -811 -807 -802 -793 -788 -784 -769 -744 -736 -730 -720 -717 -702 -686 -675 -670 -665 -629 -618 -615 -612 -602 -597 -592 -589 -575 -558 -551 -546 -540 -492 -489 -482 -454 -451 -448 -445 -442 -439 -436 -423 -420 -417 -414 -389 -359 -344 -329 -324 -295 -277 -258 -253 -250 -247 -243 -199 -182 -179 -175 -172 -149 -134 -129 -126 -103 -99 -74 -70 -48 -45 -42 -39 -36 -33 -24 
>AI3    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TTATATATTTn>AATACTAAAAATATAACTACATTACTTTTTTAATATATATAACAATATAT
ATATATATATATATTAan>ATTATATAAAATATAATACTCTATATTAAATATTAan>TTTTTATCA
ATATTTn>ATTTATATATATAATAan>ATAan>ATAan>ATAan>ATAATCAATATTAan>ATTn>ATTTATATATATA
AGATTAATAan>TTAan>TTTn>AATA>TATTATGAATAATT>TAATTn>AATAAATCTTTAAATATTATCA
TAAAAATATAAATTAAATAATTTCTTATTTATAATAAAGAATAATAan>ATATATATAAATAT
AATAAAGAATGTAAATAATATATATATAATA>TAATA>TAATATAAAAAATATATATATATA
TAAATATATATATAATATATAGATAATAan>ATAan>TTTTTATATAATT>TATTT>TATTAan>TTAAGT
AATAAATAATAAAAAAATCAATATATTAAATAATA>TATTTATATTAGTTCGGTTTAGTTG
GTATTTTGTAATGAGTAAAAAGTAATATATAATAan>TTAAATAATAAGTATTGATATAAGTA
ATAGATATAATAan>ATAan>ATAan>TTAan>TTAan>ATAan>TTTTATATAAATAATAan>TTAan>ATAan>ATATAGATTAT
GAAAGAGAGTATTAATATCATTAAATATATATATATGTTATATAATTTAAATGATTTTAA
TATATATATATATATTA>TATTATAGATTATGATACATTTATATAAATAATATATATATAA
AAATTAATTATACTATTACTTTATAATA>TAATAan>ATAan>TTTn>ATTTATAAAGATATAAAAGAA
TTGTTTAAAGTTATAACTAAAATATTATATAGTATTCATTAATAan>ATTn>AATAan>TTATAAATT
CAACTATTGTTATATTTATAAATAGAATAATA>TATTAan>TTATCCTTTAAGATATAACAATA
ATTn>ATTTAAATTAAATTAAATTAAATTTAATTn>AATTTTTTTTTTTAATGAATATAATAan>AT
AATAan>ATAan>TTAan>TTAAAATTAATATATAAAAAAAAAGTAAAA
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
WTAWTW: -17 -20 -26 -29 -32 -35 -38 -41 -66 -76 -81 -86 -95 -119 -122 -127 -165 -168 -171 -175 -192 -195 -243 -246 -251 -269 -273 -288 -291 -317 -322 -337 -372 -382 -385 -407 -410 -413 -416 -419 -432 -435 -438 -441 -444 -447 -475 -478 -482 -485 -492 -544 -547 -551 -568 -571 -575 -582 -585 -608 -611 -622 -633 -649 -658 -663 -668 -679 -682 -695 -700 -710 -713 -723 -740 -744 -751 -762 -765 -777 -780 -795 -800 -807 -810 -831 -835 -845 -848 -851 -854 -857 -888 -891 -895 -910 -919 -923 -954 -976 
>AI3	Upstream Sequence Complementary Strand
AATATATAAATTATGATTTTTATATTGATGTAATGAAAAAATTATATATATTGTTATATA
TATATATATATATAATTn>AATATATTTTATATTATGAGATATAATTn>TATAan>ATAAAAATAGT
TATAAATAAATATATATATTATTan>ATTan>ATTan>ATTan>ATTAGTTATAATTn>AATAAATATATATAT
TCTAATTATAan>ATAAATTATA>TAATACTTATTAAATTAATTan>ATTTAGAAATTTATAan>ATAGT
ATTTTTATATTTAATTn>TATTAAAGAATAAATATTATTTCTTATTATTan>ATATATATTTATA
</span>TTATTTCTTACATTTATTan>ATATATATATTATA>TTATA>TTATATTTTTTATATATATATAT
ATTTATATATATATTATATATCTATTATTan>ATAAAAATATATTAAATAAAATAATAan>ATTCA
TTATTn>TATTan>ATTTTTTTAGTTATATAATTn>TATTan>ATATAAATATAATCAAGCCAAATCAAC
CATAAAACATTACTCATTTTTCATTATATATTATAan>ATTn>TATTan>ATTCATAACTATATTCAT
TATCTATATTATTan>ATTan>ATAan>ATAan>ATTan>ATAAAATATATTTATTan>ATAan>ATTan>ATTan>ATATCTAATA
CTTTCTCTCATAATTan>ATAGTAATTTATATATATATACAATATATTAAATTTACTAAAATT
ATATATATATATATAATA>TAATATCTAATACTATGTAAATATATTTATTan>ATATATATATT
TTTAATTn>AATATGATAATGAAATATTATA>TTATTan>ATAAATAAATATTTCTATATTTTCTT
AACAAATTTCAATATTGATTTTATAan>ATATATCATAAGTAATTATTn>AATTan>ATAan>ATATTTAA
GTTGATAACAATATAAATATTTATCTTATTATA>TAATAan>ATAGGAAATTCTATATTGTTAT
TAATAAATTTAATT>TAATT>TAATTTAAATTAATTAAAAAAAAAAATTACTTATATTATTan>A
TTATTan>ATAan>ATAan>ATTTTAATTan>ATATATTTTTTTTTCATTTT
w3c xhtml validator w3c css validator