Yeastract
Please fill in here our
user satisfaction survey
Thank you!
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Go Back > View Contact/Credits     Tutorial     Help

 

Locus Information

Standard Name BRR2
Systematic Name YER172C
Alias PRP44, RSS1, SLT22, SNU246
Strain S288c
Description RNA-dependent ATPase RNA helicase (DEIH box); required for disruption of U4/U6 base-pairing in native snRNPs to activate the spliceosome for catalysis; homologous to human U5-200kD
External sources Open in SGD external link
Open in KEGG external link
Gene Sequence
Download FASTA
Hide Seq
>BRR2 YER172C
ATGACTGAGCATGAAACGAAGGATAAGGCCAAAAAAATTAGAGAAATTTATCGTTATGAT
GAGATGTCCAATAAGGTGTTGAAAGTTGATAAACGCTTTATGAATACCAGCCAAAATCCT
CAAAGGGATGCGGAAATATCACAACCAAAATCCATGAGTGGTAGAATTAGTGCTAAGGAT
ATGGGACAGGGCCTGTGCAATAACATTAATAAAGGACTAAAAGAAAATGATGTAGCCGTT
GAAAAAACTGGAAAGAGCGCATCATTGAAAAAAATTCAGCAGCATAACACCATTTTGAAT
TCTTCCTCCGATTTCAGGTTACATTATTATCCAAAGGATCCCTCAAATGTCGAAACTTAC
GAGCAGATTTTGCAGTGGGTTACAGAAGTTTTAGGCAATGATATACCCCATGATCTTATT
ATTGGAACTGCTGATATATTCATCAGACAATTGAAAGAAAATGAGGAAAATGAGGATGGT
AATATTGAAGAGCGAAAGGAAAAGATCCAGCATGAGCTAGGCATCAATATAGACTCCCTG
AAGTTTAACGAATTAGTTAAACTTATGAAAAACATTACCGATTATGAAACACATCCTGAC
AATAGCAATAAACAAGCAGTAGCAATTCTTGCCGATGATGAAAAATCAGATGAAGAAGAA
GTAACAGAAATGTCCAACAATGCTAATGTTCTTGGGGGAGAAATCAATGATAATGAAGAT
GATGATGAGGAATATGATTACAATGACGTTGAAGTCAATTCTAAAAAAAAAAACAAGAGG
GCATTGCCAAACATTGAAAACGATATAATTAAACTCTCCGATAGTAAAACAAGTAATATC
GAGAGCGTTCCGATATACTCAATCGATGAATTTTTTTTGCAGAGAAAACTTCGGTCAGAG
CTTGGTTACAAGGATACCTCTGTAATACAAGACCTGTCAGAAAAAATTTTGAATGATATT
GAAACACTTGAGCATAATCCAGTAGCGTTGGAGCAGAAGTTGGTTGATCTGCTTAAATTC
GAGAATATATCACTGGCTGAATTTATTCTCAAGAATAGATCTACAATTTTTTGGGGCATA
CGACTGGCGAAGAGCACAGAGAATGAAATACCGAACTTAATAGAGAAAATGGTTGCAAAA
GGTTTGAATGATCTTGTGGAACAGTATAAATTTAGAGAAACTACACACTCAAAGCGTGAA
CTCGATTCCGGTGACGACCAGCCACAGTCTTCGGAAGCAAAAAGAACAAAATTCAGTAAT
CCAGCAATACCGCCCGTCATAGATTTGGAAAAGATTAAATTCGACGAAAGTTCTAAATTA
ATGACCGTGACAAAAGTATCCCTACCGGAAGGATCATTCAAAAGGGTGAAACCACAATAT
GACGAAATACATATTCCAGCTCCTAGCAAACCTGTTATTGATTATGAGTTGAAAGAAATT
ACTTCTCTACCAGATTGGTGTCAGGAGGCGTTTCCTTCATCGGAAACAACGTCCTTAAAC
CCTATACAATCAAAGGTTTTTCACGCAGCATTTGAAGGTGATTCAAACATGCTAATATGT
GCACCCACTGGTTCAGGTAAGACGAATATCGCGTTATTGACGGTATTGAAAGCCTTATCC
CATCATTATAACCCGAAAACTAAGAAATTAAACCTTTCTGCATTTAAAATTGTTTATATA
GCACCCTTGAAAGCCTTAGTACAGGAACAAGTCCGAGAATTTCAAAGGAGGTTGGCTTTT
CTAGGTATAAAAGTCGCTGAATTGACTGGTGATTCTAGGCTTAGTAGAAAGCAAATTGAC
GAGACGCAGGTTTTGGTGTCTACGCCAGAGAAATGGGACATAACTACTAGAAATTCAAAT
AATTTGGCCATCGTAGAACTTGTTCGTTTGTTGATTATAGATGAAATACATTTGTTACAT
GATGACAGGGGACCAGTATTGGAAAGCATCGTGGCTAGGACATTTTGGGCTTCCAAATAT
GGCCAGGAATACCCCAGAATAATAGGCCTTTCTGCCACCTTACCAAATTATGAGGATGTC
GGTAGGTTTTTAAGAGTTCCGAAGGAAGGATTGTTTTATTTTGACTCCTCATTTAGACCG
TGTCCTCTATCTCAACAGTTTTGTGGCATTAAGGAACGGAACTCCTTGAAAAAGCTGAAG
GCTATGAATGATGCTTGTTATGAAAAGGTATTGGAATCCATCAATGAAGGTAATCAAATA
ATCGTGTTTGTTCATTCTCGAAAAGAAACATCACGAACAGCAACATGGTTGAAAAATAAA
TTTGCTGAAGAGAACATTACTCATAAATTAACCAAAAATGATGCAGGATCGAAGCAGATT
TTAAAGACAGAAGCAGCCAACGTACTCGATCCAAGTCTACGAAAGTTGATTGAAAGCGGT
ATAGGGACGCATCACGCAGGGCTGACCAGAAGTGACAGATCCTTATCTGAAGATTTATTT
GCAGACGGGTTGTTGCAAGTATTGGTATGCACTGCGACGTTAGCATGGGGTGTTAATCTA
CCTGCTCATACAGTGATTATAAAAGGAACAGATGTCTATTCACCTGAAAAGGGGTCCTGG
GAACAACTTTCTCCACAAGATGTACTTCAAATGTTAGGTAGAGCAGGCAGACCGAGATAT
GACACATTTGGCGAGGGTATTATAATAACAGACCAATCGAATGTTCAATATTATCTCTCG
GTTTTAAATCAACAATTACCAATAGAATCGCAATTTGTTTCAAAATTAGTTGACAACTTA
AATGCAGAAGTTGTCGCGGGTAACATTAAGTGCAGGAATGATGCTGTGAATTGGTTGGCG
TATACTTACCTATATGTCAGAATGTTAGCTTCCCCTATGCTTTACAAAGTACCTGATATT
TCAAGTGATGGGCAATTGAAAAAGTTTAGAGAAAGCTTAGTCCATTCGGCCCTATGCATT
TTAAAAGAACAAGAGTTGGTGTTATATGATGCTGAAAATGATGTAATTGAGGCGACCGAT
CTAGGAAATATAGCGTCGTCATTTTACATAAATCATGCTTCCATGGATGTTTACAATAGA
GAGTTAGATGAACATACAACTCAGATTGATCTTTTTAGAATATTCTCAATGTCGGAAGAG
TTTAAGTACGTATCGGTGAGATATGAAGAGAAAAGAGAACTAAAACAACTTCTAGAGAAA
GCACCCATTCCTATCAGAGAAGATATTGATGATCCTTTAGCAAAAGTGAATGTACTACTG
CAGTCTTATTTTTCCCAGCTAAAGTTCGAAGGTTTTGCACTTAATTCTGATATAGTGTTT
ATTCACCAAAATGCTGGTAGGTTATTGCGTGCTATGTTTGAAATATGCTTGAAGAGAGGA
TGGGGACATCCCACACGGATGTTGTTAAATCTTTGCAAATCTGCCACAACTAAAATGTGG
CCAACAAACTGTCCTTTAAGACAGTTTAAAACATGCCCTGTCGAAGTGATTAAAAGGCTG
GAAGCCTCTACAGTACCGTGGGGAGATTATCTACAGCTAGAAACACCTGCCGAAGTTGGT
CGTGCAATCAGATCTGAAAAATATGGAAAACAGGTTTACGATTTATTGAAAAGATTTCCC
AAAATGTCCGTAACATGCAACGCTCAGCCAATTACCCGTAGCGTTATGAGGTTCAACATT
GAAATAATAGCCGACTGGATATGGGATATGAATGTACACGGTTCCCTTGAACCTTTTTTG
CTCATGCTAGAAGACACTGATGGTGATTCAATACTTTATTATGACGTACTATTCATCACT
CCAGATATAGTTGGTCATGAATTTACCTTATCCTTTACTTATGAGTTAAAGCAGCACAAT
CAAAATAACTTACCACCTAATTTCTTCCTTACTTTGATATCAGAAAATTGGTGGCACAGT
GAATTCGAGATTCCAGTTTCCTTCAATGGATTTAAACTTCCGAAAAAATTTCCTCCTCCT
ACTCCCCTTCTGGAGAATATTAGTATTTCAACATCAGAGCTTGGCAATGATGATTTTTCC
GAAGTATTTGAATTTAAAACTTTCAACAAGATTCAGAGCCAGGTCTTCGAGTCTCTCTAC
AATTCGAATGACTCGGTCTTTGTAGGTTCAGGAAAGGGCACAGGTAAAACAGCTATGGCT
GAATTAGCACTGTTAAATCATTGGAGACAGAATAAAGGAAGAGCGGTTTATATCAATCCG
TCTGGGGAAAAAATTGATTTTTTGCTATCTGATTGGAATAAAAGGTTCTCTCATCTTGCT
GGTGGTAAGATAATAAATAAGCTAGGAAATGATCCTTCACTAAATTTAAAATTATTAGCA
AAAAGCCATGTTCTCTTGGCTACCCCCGTGCAATTTGAGCTTTTGTCACGTCGTTGGAGA
CAAAGGAAGAACATCCAAAGTTTAGAATTAATGATATATGATGACGCTCATGAGATTAGC
CAAGGTGTTTACGGTGCTGTGTATGAAACGCTAATTTCTAGAATGATATTTATAGCAACC
CAACTTGAAAAGAAAATTCGATTTGTTTGCCTTTCGAACTGTTTGGCAAATGCTCGTGAT
TTTGGTGAATGGGCTGGTATGACGAAGTCAAACATCTACAACTTTTCTCCAAGCGAAAGA
ATTGAGCCTCTTGAAATTAATATTCAGTCATTTAAAGATGTTGAGCACATATCATTCAAT
TTTTCGATGCTTCAAATGGCATTTGAAGCATCTGCTGCTGCAGCGGGAAATCGTAATTCC
AGTTCGGTGTTCTTACCATCTAGAAAGGATTGTATGGAAGTTGCGTCTGCATTTATGAAG
TTTTCAAAAGCAATTGAATGGGATATGTTGAACGTTGAAGAAGAGCAAATTGTACCATAC
ATTGAAAAGTTAACAGATGGTCATCTAAGAGCACCTTTAAAACACGGTGTTGGTATTTTG
TATAAGGGGATGGCATCAAATGATGAAAGAATTGTGAAAAGGTTATACGAATATGGTGCG
GTATCGGTTTTACTCATTTCTAAGGATTGTTCTGCATTCGCTTGTAAAACTGATGAAGTG
ATTATTTTAGGAACCAACCTTTATGATGGTGCAGAGCATAAATATATGCCATATACCATA
AATGAACTTCTAGAAATGGTGGGACTAGCTAGTGGTAACGATTCAATGGCAGGCAAGGTT
TTAATTTTGACAAGTCACAACATGAAGGCCTACTACAAAAAATTCTTAATTGAGCCTTTG
CCTACTGAGAGTTACCTACAGTATATTATTCATGATACTCTGAACAACGAGATAGCAAAT
TCTATTATACAAAGCAAACAAGATTGTGTTGACTGGTTTACATATTCGTATTTCTATCGT
CGTATCCATGTGAATCCAAGCTATTATGGCGTAAGGGATACGTCTCCACATGGAATTTCA
GTTTTTTTGAGTAATTTAGTTGAAACTTGTTTGAATGACTTAGTTGAATCATCCTTCATT
GAAATTGACGATACAGAAGCTGAAGTAACCGCAGAAGTTAATGGAGGAGATGATGAAGCA
ACTGAAATCATTTCTACCTTGAGCAACGGGCTAATTGCTTCTCACTATGGCGTATCATTT
TTTACTATTCAGTCATTCGTTTCTTCTTTATCGAATACGTCAACGCTCAAAAACATGCTG
TATGTTCTTTCAACAGCAGTAGAATTCGAAAGTGTTCCACTCAGAAAAGGAGACAGAGCA
TTACTTGTCAAATTAAGTAAAAGACTACCATTGAGATTCCCTGAACACACCTCTTCTGGT
TCGGTGAGCTTTAAAGTTTTCTTATTGTTACAAGCATATTTTTCACGTCTTGAATTACCT
GTCGACTTTCAAAATGATTTAAAAGACATTCTAGAAAAGGTTGTTCCACTAATTAACGTA
GTGGTTGATATCCTTTCAGCAAACGGGTATTTGAATGCTACTACCGCCATGGATTTGGCG
CAGATGTTGATTCAGGGTGTATGGGACGTTGATAATCCGTTGAGACAGATTCCACACTTC
AACAACAAAATTTTGGAAAAATGTAAAGAAATTAACGTCGAGACGGTCTATGATATAATG
GCCCTTGAGGATGAAGAGAGGGATGAAATTTTAACGCTTACTGATTCACAGCTTGCGCAG
GTCGCCGCGTTTGTTAACAATTACCCCAACGTTGAACTTACTTATTCGTTGAATAATTCT
GATTCGTTAATTTCAGGTGTAAAACAGAAAATTACCATTCAATTGACAAGAGATGTTGAA
CCTGAGAACTTACAAGTAACATCTGAAAAGTATCCGTTTGATAAGCTAGAAAGTTGGTGG
TTGGTTTTAGGTGAAGTATCTAAAAAAGAGCTTTATGCGATCAAGAAAGTTACTTTAAAT
AAAGAGACTCAGCAATATGAATTGGAATTTGACACTCCGACATCTGGTAAACATAACTTA
ACAATTTGGTGTGTCTGTGATTCATATCTTGACGCAGATAAAGAGTTGTCCTTTGAAATA
AATGTGAAATAA
Promoter Sequence
Download FASTA
>BRR2 YER172C
TCAATACCAAATTTGCGATAATTATTATCGTTCTCTGGAATTTCACATTCAGTTATACAT
ATAACAAGGGGAGGTAATAGAGGCTCCGAACTATATAGCCACTGTAATATAAGTTGTTGA
AATCGACGTCTGGTATCTATATGGAAGACGTTGGGAAGGTCCTCGATAAGTATTAATGAC
AGGTTGGACATCACAAGATACCGTGCGCCTTTTAAGAACTCACTAAAGCTTTCCATCTGA
GGAAGATCGTTGACTATACAATCACCTCTAAACTCGGTCACTTTATGCTCGTTCGGGGTG
CTTCGAAAGGACGTTCCGTTGCTGTTTTGTCTGTATTTAGGAACTAAGATTTTTGAGAGT
TCTTTTATGACCGTACTTTTAGAGCATCCACTGGGGCCAGACAGTAGTAGGATCCTATGC
TTGGCGTTAGGTAAAAACATGGCATCTAAAGCTTCTTGTACATCTTTAAGTTTTCTTTTA
TGTATGGCCACTTGCTCCAAACAATTGGGCTTGAACTTTTCGTACCACTGTTCACCGCCG
TCGTCGTTGATACTTGGGAGGATACTAGACGTATCTTGCTTGGAAAGAAAGTCATTTTCA
GTGCTTCTCGCCTTACGAACTGGCGAAGTCGGTCTAGATGAGCTCCATTTTGTTATTTGC
GAGCCCAATGAACTGAGACTATATTGTAATAAGGGCCGTTTGTTCAAATTCGTACTATCC
ATATCATTCAGACAGGAACAAACTTGATAATTAGTGGTGTTGAATCAAGTACTATTAACG
CATTGTGATGATCTCTCAGATATCAATGCGTGTTTGCTTCTTTGACGATCTAATATTGAA
TATTGTCGCTCTTTACGAGAATATTAAAAATTTATGCTACTAAAGCTATGTCTACTATAA
AGGAATAATACACTAATAGAGATAATCTTGAGTAAAATAAGGTGAAGGTAAATATAAGTA
ATTGCTTTGGAAGATTTACCGTGAGCCTTCGTTATTAAAA
Chr coordinates Chr V from 536021-529530
w3c xhtml validator w3c css validator