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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name VMA3
Promoter Sequence

No match found!
>VMA3    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
ATATACGCCTTCATAACTATATTTGAAAAATACCTTTGCCTAAAAGACGAGTGGTATTGG
AAACTTCAATTAGTGTTCAAAAATGTCCAGTGAGAGGATGAAGTTGTCGTGGTTGAAACA
GCATAAACCACCTAAAATAGTATCAACTGACAACAACTGTGGAACACATGCGGTTACTTT
TATAATTAACCGCAAAATACCTGAAATGAGCTAAGAAATAGTAATTATAAACATGCCACT
ACAAGTAACAGATTAAGTGATATGTTGGCGGACCTCAATATAAGCGACATGGAGAGATAG
AGATAGAAGAATTTGTTATTGTGTTAATAAATAAAGTTAACATCCAGTTCTTTCAAGTTG
GCTAAGCGCCGTGGCGCAGTGGAAGCGCGCAGGGCTCATAACCCTGATGTCCTCGGATCG
AAACCGAGCGGCGCTAATTTTTCATTTCTTTTTGCCCGCAACAATAACACAGATCGCAAT
CATTTAAGCTATAGACTATAAGCTTTAACTTCTGCGTTATTATTAATAATTGTTATTGTT
TTAGTTAGGTATTTCTATCAACTTATTTTATATATTCTATATTACAGTTTTCTTTTTTTA
CAAATTCACCCAGCAATTATTTATTATTAATTGTACATCTTCTTTAATAATGAATTTATT
ATTGCACAATATTCAACTTAGGAAAGATAGAGGAACTGAATTCTTTATCAGCAATGAAAT
AGGCCGTCTACGGCCGTCTACGGCCTATTCCATTGCTAAAAATTTGAATCGTATAAAGGG
ATATTACCCGGAAAAGAAACGCATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAGAAAAAGTGGT
TAAGTGATTGACTGACCCTTGATAGTTTTGTACAATTATACACTCGTTCTGATTAAAAAC
TTGTTTATAAAAATCTTTTTAAAAGAAAGAGAAGATCGTGTTTATTGCTTTTCTCAAAAA
GACTAATCAATTAGAATAACAAAAGAAACATATACATATA
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
TCCGHGGA: -583
>VMA3	Upstream Sequence Complementary Strand
TATATGCGGAAGTATTGATATAAACTTTTTATGGAAACGGATTTTCTGCTCACCATAACC
TTTGAAGTTAATCACAAGTTTTTACAGGTCACTCTCCTACTTCAACAGCACCAACTTTGT
CGTATTTGGTGGATTTTATCATAGTTGACTGTTGTTGACACCTTGTGTACGCCAATGAAA
ATATTAATTGGCGTTTTATGGACTTTACTCGATTCTTTATCATTAATATTTGTACGGTGA
TGTTCATTGTCTAATTCACTATACAACCGCCTGGAGTTATATTCGCTGTACCTCTCTATC
TCTATCTTCTTAAACAATAACACAATTATTTATTTCAATTGTAGGTCAAGAAAGTTCAAC
CGATTCGCGGCACCGCGTCACCTTCGCGCGTCCCGAGTATTGGGACTACAGGAGCCTAGC
TTTGGCTCGCCGCGATTAAAAAGTAAAGAAAAACGGGCGTTGTTATTGTGTCTAGCGTTA
GTAAATTCGATATCTGATATTCGAAATTGAAGACGCAATAATAATTATTAACAATAACAA
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GTTTAAGTGGGTCGTTAATAAATAATAATTAACATGTAGAAGAAATTATTACTTAAATAA
TAACGTGTTATAAGTTGAATCCTTTCTATCTCCTTGACTTAAGAAATAGTCGTTACTTTA
TCCGGCAGATGCCGGCAGATGCCGGATAAGGTAACGATTTTTAAACTTAGCATATTTCCC
TATAATGGGCCTTTTCTTTGCGTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTCTTTTTCACCA
ATTCACTAACTGACTGGGAACTATCAAAACATGTTAATATGTGAGCAAGACTAATTTTTG
AACAAATATTTTTAGAAAAATTTTCTTTCTCTTCTAGCACAAATAACGAAAAGAGTTTTT
CTGATTAGTTAATCTTATTGTTTTCTTTGTATATGTATAT